| 查看: 8086 | 回复: 5 | |||
[求助]
如何将自己的氨基酸序列转换获得.pdb格式文件 已有1人参与
|
|
小弟最近需要进行蛋白三级结构的模拟建模,使用的软件是pymol、rasmol,但是这两个软件都是识别.pdb格式的蛋白序列文档,有没有大神教教我如何将自己手头上的氨基酸序列(.fasta)转换成可以被建模软件识别的.pdb格式,谢谢 注:1.本人手头上的序列在PDB,ncbi等数据库比对后未找到已有的数据; 2.尝试了使用OpenBABEL进行转换,不知道是哪里没有设置好转换出来的用pymol、rasmol读取后都是直线型,下了一个GFP的.fasta和.pdb作为对照,转换 后也是直线型与直接下的.pdb不一致。 |
» 猜你喜欢
Calderasib理化性质与实验操作技术笔记
已经有0人回复
RMC-6291怎么用?RAS(ON) 三重复合物工具化合物的实验室实操要点
已经有0人回复
化学工程及工业化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有121人回复
苯并呋咱全解析:NBD 荧光衍生化试剂母核的化学特性与实验室应用
已经有0人回复
生物质炭与活化剂氢氧化钾混合注意事项
已经有0人回复
科研人必读:新一代 KRAS G12C 抑制剂 Olomorasib 的研究进展
已经有0人回复
BT-11(Omilancor)研究化合物全解析:从分子结构到实验应用要点
已经有0人回复
富马酸贝达喹啉:二芳基喹啉类工具化合物的化学特征
已经有0人回复
BT投稿with editor状态快两周了,正常吗
已经有25人回复
Silevertinib(BDTX-1535)结构拆解:炔基双环片段为何成为合成瓶颈
已经有0人回复
RO4929097 解析:双苯并氮杂䓬骨架与 Notch 通路实验设计要点
已经有0人回复
★
西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2018-09-22 10:29:48
西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2018-09-22 10:29:48
|
swiss model,同源建模,把你氨基酸序列输入,结果中可以现在pdb文件的蛋白结构文件 发自小木虫Android客户端 |

2楼2018-09-13 12:26:15
3楼2018-09-13 12:32:41

4楼2018-09-13 17:26:26
5楼2018-09-21 08:51:59
6楼2018-09-21 14:31:45










回复此楼