| 查看: 2395 | 回复: 10 | ||
[求助]
NCBI BLAST和构建发育树，哪种方法能够更准确地确认序列的种属 已有1人参与
|
||
|
求助！！！！ 最近在构建发育树的时候发现个问题：我自己扩增出来的序列（环境样品），在NCBI上与已知种属序列A的相似度到达98%。可是在构建发育树的时候，我自己扩增出来的序列，怎么都跟参考序列A建不到一簇，反而跟参考序列B建到一块了（其中，参考序列A和参考序列B属于同一个属，但是不同种）。而与参考序列A的相似度仅为95%的序列，竟与参考序列A建到一簇了。为什么？？？？？ 1、细菌16S的序列，相似度为多少能归到一个种？ 2、NCBI BLAST的结果与发育树的结果为什么不能一一对应？哪个方法更能确认序列的种属呢？ |
回复此楼» 猜你喜欢
筑牢营养安全线：以精准检测，护健康基石
已经有0人回复
-
推荐一些20种氨基酸检测的实际应用案例
已经有0人回复
-
化学工程及工业化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有286人回复
-
不合理蛙科研实验中的趣事：实验器材的 “乌龙”
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验中的趣事：和实验材料的 “斗智斗勇”
已经有0人回复
-
蛋白质检测：精准分析，解锁生物分子的密码
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之小鼠实验：严谨设计，解析生命机制的重要载体
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之重金属检测：精准筛查，守护健康与环境的防线
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之“蛙测重金属我背锅三千”
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之“鼠逃三次我发三篇SCI”
已经有0人回复
xp198766
铁杆木虫 (著名写手)
小木虫职业打酱油滴~~！
- MolEPI: 1
- 应助: 5 (幼儿园)
- 金币: 6525.1
- 散金: 262
- 红花: 25
- 帖子: 2193
- 在线: 554小时
- 虫号: 1046859
- 注册: 2010-06-24
- 性别: GG
- 专业: 环境微生物学
10楼2018-04-18 17:30:24
上善若水白杨
金虫 (小有名气)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 1253.6
- 散金: 11
- 帖子: 295
- 在线: 13小时
- 虫号: 8319314
- 注册: 2018-03-19
- 性别: MM
- 专业: 昆虫学
2楼2018-04-16 23:42:56
3楼2018-04-17 09:21:19
xp198766
铁杆木虫 (著名写手)
小木虫职业打酱油滴~~！
- MolEPI: 1
- 应助: 5 (幼儿园)
- 金币: 6525.1
- 散金: 262
- 红花: 25
- 帖子: 2193
- 在线: 554小时
- 虫号: 1046859
- 注册: 2010-06-24
- 性别: GG
- 专业: 环境微生物学
4楼2018-04-17 13:48:28
上善若水白杨
金虫 (小有名气)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 1253.6
- 散金: 11
- 帖子: 295
- 在线: 13小时
- 虫号: 8319314
- 注册: 2018-03-19
- 性别: MM
- 专业: 昆虫学
5楼2018-04-17 16:32:26
上善若水白杨
金虫 (小有名气)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 1253.6
- 散金: 11
- 帖子: 295
- 在线: 13小时
- 虫号: 8319314
- 注册: 2018-03-19
- 性别: MM
- 专业: 昆虫学
6楼2018-04-17 16:32:56
7楼2018-04-18 08:34:32
xp198766
铁杆木虫 (著名写手)
小木虫职业打酱油滴~~！
- MolEPI: 1
- 应助: 5 (幼儿园)
- 金币: 6525.1
- 散金: 262
- 红花: 25
- 帖子: 2193
- 在线: 554小时
- 虫号: 1046859
- 注册: 2010-06-24
- 性别: GG
- 专业: 环境微生物学
8楼2018-04-18 15:09:58
9楼2018-04-18 16:52:26