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NCBI BLAST和构建发育树,哪种方法能够更准确地确认序列的种属 已有1人参与
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求助!!!! 最近在构建发育树的时候发现个问题:我自己扩增出来的序列(环境样品),在NCBI上与已知种属序列A的相似度到达98%。可是在构建发育树的时候,我自己扩增出来的序列,怎么都跟参考序列A建不到一簇,反而跟参考序列B建到一块了(其中,参考序列A和参考序列B属于同一个属,但是不同种)。而与参考序列A的相似度仅为95%的序列,竟与参考序列A建到一簇了。为什么????? 1、细菌16S的序列,相似度为多少能归到一个种? 2、NCBI BLAST的结果与发育树的结果为什么不能一一对应?哪个方法更能确认序列的种属呢? |
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