| 查看: 1680 | 回复: 15 | ||
[求助]
ENCUT收敛性脚本测试问题 已有2人参与
|
||
|
各位大神好 小弟是vasp小白 请问大家 如何将侯博有关vaspENCUT收敛性测试的脚本用在自己的run文件中啊 小弟是连在服务器上计算的 所以需要执行任务的脚本文件 恳请各位大神指导 谢谢 以下是小弟的PBS执行文件 和侯博的ENCUT文件 #!/bin/bash #========================================# # PBS Job submission script for VASP #========================================# # 1. PBS job control #PBS -S /bin/bash #PBS -N vasp #PBS -j oe #PBS -q long #PBS -l nodes=1:ppn=16 #PBS -l walltime=480:00:00 #PBS -V #========================================# # 2. Job specification cd ${PBS_O_WORKDIR} inputfile="INCAR" #========================================# export MKL_SERIAL=YES export MKL_NUM_THREADS=1 export OMP_NUM_THREADS=1 export GOTO_NUM_THREADS=1 echo this jobs runs on the following machines: echo `cat $PBS_NODEFILE | uniq ` PROCS=`cat $PBS_NODEFILE | wc -l` cat $PBS_NODEFILE | uniq > user.$PBS_JOBID NP=`cat $PBS_NODEFILE|wc -l` ## for Intel MPI ## /opt/openmpi-1.4.4/bin/mpirun -np $NP -machinefile user.$PBS_JOBID ~/bin/vasp >& out ======================================================================================= #!/bin/sh rm WAVECAR for i in 150 200 250 300 350 400 do cat > INCAR <<! SYSTEM = Si-Diamond ENCUT = $i ISTART = 0 ; ICHARG = 2 ISMEAR = -5 PREC = Accurate ! echo "ENCUT = $i eV" ; time vasp E=‘grep "TOTEN" OUTCAR | tail -1 | awk ’{printf "%12.6f \n", $5 }’‘ echo $i $E >>comment done |
回复此楼» 猜你喜欢
面上函评意见出来了，像什么等级？
已经有17人回复
-
为什么国自然不能直接公布
已经有5人回复
-
梦想
已经有7人回复
-
学科评审组评审是指会评吗？
已经有4人回复
-
面上合作单位盖章
已经有8人回复
-
为什么资助数各大高校都创新高，自己申请怎么就这么难
已经有14人回复
-
小白求助 投论文要求的highlights应该如何写
已经有4人回复
-
麻烦专家们看看评委们的意见（F口面上）
已经有12人回复
-
怎么看青基中了没有啊
已经有6人回复
-
国社科又开始会评了，不知道这次命运如何
已经有11人回复
wlandy
铁杆木虫 (正式写手)
知道自己不知道
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 7953.4
- 红花: 3
- 帖子: 886
- 在线: 83.9小时
- 虫号: 2923551
- 注册: 2014-01-09
- 性别: GG
- 专业: 凝聚态物性 II ：电子结构
4楼2018-04-12 17:58:59
| 顶 |
2楼2018-04-12 17:36:54
3楼2018-04-12 17:37:14
5楼2018-04-12 18:40:58
| 顶 |
6楼2018-04-12 19:46:14
| 顶 |
7楼2018-04-12 20:16:11
8楼2018-04-12 20:31:50
9楼2018-04-12 20:57:46
wlandy
铁杆木虫 (正式写手)
知道自己不知道
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 7953.4
- 红花: 3
- 帖子: 886
- 在线: 83.9小时
- 虫号: 2923551
- 注册: 2014-01-09
- 性别: GG
- 专业: 凝聚态物性 II ：电子结构
10楼2018-04-13 11:23:13
20
投票:
