| 查看: 1677 | 回复: 15 | ||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | ||
[求助]
ENCUT收敛性脚本测试问题 已有2人参与
|
||
|
各位大神好 小弟是vasp小白 请问大家 如何将侯博有关vaspENCUT收敛性测试的脚本用在自己的run文件中啊 小弟是连在服务器上计算的 所以需要执行任务的脚本文件 恳请各位大神指导 谢谢 以下是小弟的PBS执行文件 和侯博的ENCUT文件 #!/bin/bash #========================================# # PBS Job submission script for VASP #========================================# # 1. PBS job control #PBS -S /bin/bash #PBS -N vasp #PBS -j oe #PBS -q long #PBS -l nodes=1:ppn=16 #PBS -l walltime=480:00:00 #PBS -V #========================================# # 2. Job specification cd ${PBS_O_WORKDIR} inputfile="INCAR" #========================================# export MKL_SERIAL=YES export MKL_NUM_THREADS=1 export OMP_NUM_THREADS=1 export GOTO_NUM_THREADS=1 echo this jobs runs on the following machines: echo `cat $PBS_NODEFILE | uniq ` PROCS=`cat $PBS_NODEFILE | wc -l` cat $PBS_NODEFILE | uniq > user.$PBS_JOBID NP=`cat $PBS_NODEFILE|wc -l` ## for Intel MPI ## /opt/openmpi-1.4.4/bin/mpirun -np $NP -machinefile user.$PBS_JOBID ~/bin/vasp >& out ======================================================================================= #!/bin/sh rm WAVECAR for i in 150 200 250 300 350 400 do cat > INCAR <<! SYSTEM = Si-Diamond ENCUT = $i ISTART = 0 ; ICHARG = 2 ISMEAR = -5 PREC = Accurate ! echo "ENCUT = $i eV" ; time vasp E=‘grep "TOTEN" OUTCAR | tail -1 | awk ’{printf "%12.6f \n", $5 }’‘ echo $i $E >>comment done |
回复此楼» 猜你喜欢
29号明天会评吗
已经有4人回复
-
国社科又开始会评了，不知道这次命运如何
已经有10人回复
-
梦想
已经有4人回复
-
中青基了要发朋友圈吗？
已经有6人回复
-
基金不中，共勉
已经有12人回复
-
能否申诉？
已经有7人回复
-
有多少人是今天查系统知道结果的？
已经有19人回复
-
面上意见出来了
已经有19人回复
-
为什么到现在没收到通知？
已经有5人回复
-
有没有仍没收到信息的
已经有8人回复
wlandy
铁杆木虫 (正式写手)
知道自己不知道
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 7953.4
- 红花: 3
- 帖子: 886
- 在线: 83.9小时
- 虫号: 2923551
- 注册: 2014-01-09
- 性别: GG
- 专业: 凝聚态物性 II ：电子结构
4楼2018-04-12 17:58:59
5楼2018-04-12 18:40:58
wlandy
铁杆木虫 (正式写手)
知道自己不知道
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 7953.4
- 红花: 3
- 帖子: 886
- 在线: 83.9小时
- 虫号: 2923551
- 注册: 2014-01-09
- 性别: GG
- 专业: 凝聚态物性 II ：电子结构
10楼2018-04-13 11:23:13
我没有懂
11楼2018-04-13 11:55:29
