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ENCUT收敛性脚本测试问题 已有2人参与
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各位大神好 小弟是vasp小白 请问大家 如何将侯博有关vaspENCUT收敛性测试的脚本用在自己的run文件中啊 小弟是连在服务器上计算的 所以需要执行任务的脚本文件 恳请各位大神指导 谢谢 以下是小弟的PBS执行文件 和侯博的ENCUT文件 #!/bin/bash #========================================# # PBS Job submission script for VASP #========================================# # 1. PBS job control #PBS -S /bin/bash #PBS -N vasp #PBS -j oe #PBS -q long #PBS -l nodes=1:ppn=16 #PBS -l walltime=480:00:00 #PBS -V #========================================# # 2. Job specification cd ${PBS_O_WORKDIR} inputfile="INCAR" #========================================# export MKL_SERIAL=YES export MKL_NUM_THREADS=1 export OMP_NUM_THREADS=1 export GOTO_NUM_THREADS=1 echo this jobs runs on the following machines: echo `cat $PBS_NODEFILE | uniq ` PROCS=`cat $PBS_NODEFILE | wc -l` cat $PBS_NODEFILE | uniq > user.$PBS_JOBID NP=`cat $PBS_NODEFILE|wc -l` ## for Intel MPI ## /opt/openmpi-1.4.4/bin/mpirun -np $NP -machinefile user.$PBS_JOBID ~/bin/vasp >& out ======================================================================================= #!/bin/sh rm WAVECAR for i in 150 200 250 300 350 400 do cat > INCAR <<! SYSTEM = Si-Diamond ENCUT = $i ISTART = 0 ; ICHARG = 2 ISMEAR = -5 PREC = Accurate ! echo "ENCUT = $i eV" ; time vasp E=‘grep "TOTEN" OUTCAR | tail -1 | awk ’{printf "%12.6f \n", $5 }’‘ echo $i $E >>comment done |
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