应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » ENCUT收敛性脚本测试问题
162/2返回列表上一页12
查看: 1379  |  回复: 15
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

Y/XT

新虫 (小有名气)
引用回帖:
10楼: Originally posted by wlandy at 2018-04-13 11:23:13
把前面的那句这个删掉，只留time vasp位置这个

你能说的详细一点吗  我没有懂

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼
11楼2018-04-13 11:55:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Y/XT

新虫 (小有名气)
引用回帖:
10楼: Originally posted by wlandy at 2018-04-13 11:23:13
把前面的那句这个删掉，只留time vasp位置这个

你能说的清楚一点吗  我没有明白什么意思  谢谢你了
赞一下 回复此楼
12楼2018-04-13 11:59:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

前田庆次

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
#!/bin/bash
#========================================#
# PBS Job submission script for VASP
#========================================#
# 1. PBS job control

#PBS -S /bin/bash
#PBS -N vasp
#PBS -j oe
#PBS -q long
#PBS -l nodes=1:ppn=16
#PBS -l walltime=480:00:00
#PBS -V

#========================================#
# 2. Job specification

cd ${PBS_O_WORKDIR}
inputfile="INCAR"

#========================================#

export MKL_SERIAL=YES
export MKL_NUM_THREADS=1
export OMP_NUM_THREADS=1
export GOTO_NUM_THREADS=1

echo this jobs runs on the following machines:
echo `cat  $PBS_NODEFILE | uniq `
PROCS=`cat $PBS_NODEFILE | wc -l`
cat  $PBS_NODEFILE | uniq > user.$PBS_JOBID
NP=`cat $PBS_NODEFILE|wc -l`
## for Intel MPI ##

/opt/openmpi-1.4.4/bin/mpirun -np $NP -machinefile user.$PBS_JOBID  ~/bin/vasp >& out

=======================================================================================
#!/bin/sh
rm WAVECAR
for i in 150 200 250 300 350 400
do
cat > INCAR <<!
SYSTEM = Si-Diamond
ENCUT = $i
ISTART = 0 ; ICHARG = 2
ISMEAR = -5
PREC = Accurate
!
echo "ENCUT = $i eV" ; time vasp
E=‘grep "TOTEN" OUTCAR | tail -1 | awk ’{printf "%12.6f \n", $5 }’‘
echo $i $E >>comment
done
直接複製進去就可以嘍，命名為XX.sh
chmod +x XX.sh就可以了吧
另外注意那個是
E=‘grep "TOTEN" OUTCAR | tail -1 | awk ’{printf "%12.6f \n", $5 }’‘
‘這個符號是ESC那面那個東西
赞一下 回复此楼
长枪一横花飘零，松风追月伴我行。无双人间世如梦，倾奇万世永留名。
13楼2018-04-13 12:17:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Y/XT

新虫 (小有名气)
引用回帖:
13楼: Originally posted by 前田庆次 at 2018-04-13 12:17:48
#!/bin/bash
#========================================#
# PBS Job submission script for VASP
#========================================#
# 1. PBS job control

#PBS -S /bin/bash
#PBS -N vasp
#PB ...

你好我是用SSH 和服务器联在一起的  你说的复制是将候博的那个脚本作为一个文件内容一起和 POSCAR POTCAR  KPOINT run.bet 共五个文件一起放进去吗？

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼
14楼2018-04-13 14:26:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hs0218

金虫 (正式写手)

DDr.

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
如果才学vasp 最好一个个建立单独文件夹来做测试
等会了bash之后自己读懂脚本再用类似的
要不然出错了自己都排查不了
赞一下 回复此楼
路漫漫其修远兮
15楼2018-04-13 15:49:49
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Y/XT

新虫 (小有名气)
引用回帖:
15楼: Originally posted by hs0218 at 2018-04-13 15:49:49
如果才学vasp 最好一个个建立单独文件夹来做测试
等会了bash之后自己读懂脚本再用类似的
要不然出错了自己都排查不了

好的  谢谢

发自小木虫Android客户端
回复此楼
16楼2018-04-13 16:51:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 Y/XT 的主题更新
162/2返回列表上一页12
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[论文投稿] 申请回稿延期一个月，编辑同意了。但系统上的时间没变，给编辑又写邮件了，没回复 10+3 wangf9518 2026-03-17 4/200 2026-03-19 23:55 by babero
[考研] 0817 化学工程 299分求调剂 有科研经历 有二区文章 +18 rare12345 2026-03-18 18/900 2026-03-19 22:36 by 学员8dgXkO
[考研] 296求调剂 +3 www_q 2026-03-18 6/300 2026-03-19 22:28 by zhq0425
[考研] 梁成伟老师课题组欢迎你的加入 +9 一鸭鸭哟 2026-03-14 11/550 2026-03-19 17:22 by ！本暗一次！
[考研] 271材料工程求调剂 +6 .6lL 2026-03-18 6/300 2026-03-19 15:41 by haoshis
[考研] 085600材料与化工调剂 324分 +10 llllkkkhh 2026-03-18 12/600 2026-03-19 14:33 by llllkkkhh
[考研] 317求调剂 +3 申子申申 2026-03-19 6/300 2026-03-19 14:16 by 申子申申
[考研] 材料专业求调剂 +5 hanamiko 2026-03-18 5/250 2026-03-18 20:19 by 星空星月
[考研] 303求调剂 +4 睿08 2026-03-17 6/300 2026-03-18 11:01 by Iveryant
[考研] 278求调剂 +5 烟火先于春 2026-03-17 5/250 2026-03-18 08:43 by 星空星月
[基金申请] 被我言中：新模板不强调格式了，假专家开始管格式了 +4 beefly 2026-03-14 4/200 2026-03-17 22:04 by 黄鸟于飞Chao
[考研] 326求调剂 +5 上岸的小葡 2026-03-15 6/300 2026-03-17 17:26 by ruiyingmiao
[考研] 085601求调剂 +4 Du.11 2026-03-16 4/200 2026-03-17 17:08 by ruiyingmiao
[考研] 材料工程专硕274一志愿211求调剂 +6 薛云鹏 2026-03-15 6/300 2026-03-17 11:05 by 学员h26Tkc
[考研] 304求调剂 +3 曼殊2266 2026-03-14 3/150 2026-03-16 16:39 by houyaoxu
[考研] 0856求调剂 +3 刘梦微 2026-03-15 3/150 2026-03-16 10:00 by houyaoxu
[考研] 22408总分284求调剂 +3 InAspic 2026-03-13 3/150 2026-03-15 11:10 by zhq0425
[考研] 材料与化工 323 英一+数二+物化，一志愿：哈工大 本人本科双一流 +4 自由的_飞翔 2026-03-13 5/250 2026-03-14 19:39 by hmn_wj
[考研] 中科大材料专硕319求调剂 +3 孟鑫材料 2026-03-13 3/150 2026-03-14 18:10 by houyaoxu
[考研] 复试调剂 +3 呼呼？~+123456 2026-03-14 3/150 2026-03-14 16:53 by WTUChen
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭