24小时热门版块排行榜    

查看: 1479  |  回复: 7
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

三百烦恼风

银虫 (小有名气)

[求助] autodock对接clusting聚类图,能量分布很广,很均匀,没有主要构象

对接了50次,大概有十几个能量,分布得特均匀,没有主要构象。这是为啥?是我对接过程有问题,还是小分子药物根本没有抑制效果?

发自小木虫Android客户端
回复此楼
人丑就要多读书
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

longdlut

捐助贵宾 (著名写手)


引用回帖:
3楼: Originally posted by 三百烦恼风 at 2018-01-16 16:06:12
盒子参数指的是grid box 的大小吗?我设置的是包含原配体位置,盒子设置的90,90,90。是不是太大了不好。
...

嗯太大了吧,可以调整一下

发自小木虫Android客户端
4楼2018-01-17 09:23:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 8 个回答

longdlut

捐助贵宾 (著名写手)


很正常,换盒子参数,或增加次数对接

发自小木虫Android客户端
2楼2018-01-16 07:29:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

三百烦恼风

银虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by longdlut at 2018-01-16 07:29:55
很正常,换盒子参数,或增加次数对接

盒子参数指的是grid box 的大小吗?我设置的是包含原配体位置,盒子设置的90,90,90。是不是太大了不好。

发自小木虫Android客户端
人丑就要多读书
3楼2018-01-16 16:06:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

三百烦恼风

银虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by longdlut at 2018-01-17 09:23:08
嗯太大了吧,可以调整一下
...

嗯嗯,谢谢。我还想问下,如果最低能量构象并不是clusting聚类中次数最多的构象,那该选择哪个作为对接能量?

发自小木虫Android客户端
人丑就要多读书
5楼2018-01-17 21:23:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 321求调剂 +5 wasdssaa 2026-03-26 5/250 2026-03-26 18:00 by fmesaito
[考研] 一志愿 西北大学 总分282 英语一62 求调剂 +7 18419759900 2026-03-25 7/350 2026-03-26 16:07 by 不吃魚的貓
[考研] 086000生物与医药292求调剂 +6 小小陈小小 2026-03-22 9/450 2026-03-26 15:58 by dick_runner
[考研] 279 分 求调剂 +3 睡个好觉_16 2026-03-24 3/150 2026-03-26 15:43 by zzll406
[考研] 环境专硕324分求调剂推荐 +5 轩小宁—— 2026-03-26 5/250 2026-03-26 12:05 by i_cooler
[考研] 一志愿南航 335分 | 0856材料化工 | GPA 4.07 | 有科研经历 +6 cccchenso 2026-03-23 6/300 2026-03-25 22:25 by 544594351
[考研] 网络空间安全0839招调剂 +4 w320357296 2026-03-25 6/300 2026-03-25 17:59 by 255671
[考研] 【2026考研调剂】制药工程 284分 求相关专业调剂名额 +4 袁奂奂 2026-03-25 8/400 2026-03-25 14:32 by lbsjt
[考研] 0854电子信息求调剂 324 +4 Promise-jyl 2026-03-23 4/200 2026-03-25 11:36 by Sugarlight
[考研] 286求调剂 +11 Faune 2026-03-21 11/550 2026-03-25 10:11 by 雾散后相遇lc
[考研] 一志愿南航材料专317分求调剂 +5 炸呀炸呀炸薯条 2026-03-23 5/250 2026-03-24 16:52 by 星空星月
[考研] 求调剂 +7 十三加油 2026-03-21 7/350 2026-03-23 23:48 by 热情沙漠
[考研] 求调剂一志愿海大,0703化学学硕304分,有大创项目,四级已过 +6 幸运哩哩 2026-03-22 10/500 2026-03-22 20:10 by edmund7
[考研] 319求调剂 +4 小力气珂珂 2026-03-20 4/200 2026-03-22 15:53 by ColorlessPI
[考研] 269专硕求调剂 +6 金恩贝 2026-03-21 6/300 2026-03-22 14:31 by ColorlessPI
[考研] 一志愿北京化工大学070300 学硕336求调剂 +5 vv迷 2026-03-21 8/400 2026-03-22 14:20 by ColorlessPI
[考研] 材料学硕301分求调剂 +7 Liyouyumairs 2026-03-21 7/350 2026-03-21 22:31 by peike
[考研] 336求调剂 +5 rmc8866 2026-03-21 5/250 2026-03-21 17:24 by 学员8dgXkO
[考研] 330求调剂0854 +3 assdll 2026-03-21 3/150 2026-03-21 13:01 by 搏击518
[考研] 329求调剂 +9 想上学吖吖 2026-03-19 9/450 2026-03-20 22:01 by luoyongfeng
信息提示
请填处理意见