24小时热门版块排行榜    

查看: 1393  |  回复: 7
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

三百烦恼风

银虫 (小有名气)

[求助] autodock对接clusting聚类图,能量分布很广,很均匀,没有主要构象

对接了50次,大概有十几个能量,分布得特均匀,没有主要构象。这是为啥?是我对接过程有问题,还是小分子药物根本没有抑制效果?

发自小木虫Android客户端
回复此楼
人丑就要多读书
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

longdlut

捐助贵宾 (著名写手)


很正常,换盒子参数,或增加次数对接

发自小木虫Android客户端
2楼2018-01-16 07:29:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

longdlut

捐助贵宾 (著名写手)


引用回帖:
3楼: Originally posted by 三百烦恼风 at 2018-01-16 16:06:12
盒子参数指的是grid box 的大小吗?我设置的是包含原配体位置,盒子设置的90,90,90。是不是太大了不好。
...

嗯太大了吧,可以调整一下

发自小木虫Android客户端
4楼2018-01-17 09:23:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

longdlut

捐助贵宾 (著名写手)


我会选择最低能量的构象进行分析,能量越低越稳定的,法则

发自小木虫Android客户端

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

6楼2018-01-17 21:47:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 三百烦恼风 的主题更新
信息提示
请填处理意见