应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物信息 » 转录组测序数据分析的结果和荧光定量验证的结果不一致
北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
51/1返回列表
查看: 9800  |  回复: 6
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

13011231322

新虫 (小有名气)

[求助] 转录组测序数据分析的结果和荧光定量验证的结果不一致 已有3人参与

转录组数据分析的出来的差异表达基因倍数比较大，但是荧光定量验证后并没有显著性差异，分析差异表达的基因的readcount一般在多少比较比较合适？

发自小木虫Android客户端
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

测序 QPCR

» 猜你喜欢
1楼 2018-01-09 14:50:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

swearit

铁虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

1.不一致的程度分析：

A.验证30个基因，25个表达趋势一致；

B.验证30个基因，15个表达趋势一致；

C.验证30个基因，5个表达趋势一致；

D.验证3个基因，1个表达趋势一致。

2.首先，思考可能存在的原因？

如D情况，随机出现的概率会比较大，属于验证实验设计不合理，不作为讨论范围。

如A情况，属于结果一致，为了更好的表示是否一致，建议计算30个基因的相关性系数，趋势只反映上下调，不能反映倍数。一般相关性系数大于0.8，说明一致性较好

如C情况，优先考虑是否是实验组与对照组在某个实验中设置颠倒。

如B情况，相对复杂，需要一步一步来排查
引自：http://www.planttech.com.cn/blog/db3347ad80c
赞一下 回复此楼
7楼2018-01-22 12:57:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 7 个回答

hyuqing

捐助贵宾 (小有名气)

Enriching beads

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2018-01-09 21:44:23
找找不一致的原因吧，取样条件、操作流程、人为的还是天然存在的，总之只要能重复的都是可信任的结果。
转录组数据需要进行差异分析，就是针对这一类情况。你可以去了解下差异表达基因分析。方法有很多的
赞一下 回复此楼
2楼2018-01-09 15:38:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

13011231322

新虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by hyuqing at 2018-01-09 15:38:48
找找不一致的原因吧，取样条件、操作流程、人为的还是天然存在的，总之只要能重复的都是可信任的结果。
转录组数据需要进行差异分析，就是针对这一类情况。你可以去了解下差异表达基因分析。方法有很多的

好的，谢谢。

发自小木虫Android客户端
回复此楼
3楼2018-01-09 23:54:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Liumengya

木虫 (正式写手)
转录组还要看数据本身怎么样，二代数据常常质量较差。同时qpcr假阳性假阴性概率很高，有条件的话建议用northern试试

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼
4楼2018-01-10 00:49:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 7 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 318一志愿吉林大学生物与医药 求调剂 +4 笃行致远. 2026-03-28 4/200 2026-03-29 11:55 by longlotian
[考研] 309求调剂 +6 谁不是少年 2026-03-29 6/300 2026-03-29 08:11 by fmesaito
[考研] 本科新能源科学与工程，一志愿华理能动285求调剂 +7 AZMK 2026-03-28 11/550 2026-03-28 21:01 by xxxsssccc
[考研] 071000生物学求调剂，初试成绩343 +7 小小甜面团 2026-03-25 7/350 2026-03-28 20:25 by 唐沐儿
[考研] 化学0703 调剂 306分 一志愿211 +4 26要上岸 2026-03-28 4/200 2026-03-28 15:30 by 1018329917
[考研] 材料与化工（0856）304求B区调剂 +8 邱gl 2026-03-27 8/400 2026-03-28 12:42 by 唐沐儿
[考研] 材料与化工考研调剂 +17 孅華 2026-03-22 17/850 2026-03-28 08:35 by WYUMater
[考研] 291求调剂 +6 HanBeiNingZC 2026-03-24 6/300 2026-03-28 07:55 by baoball
[考研] 340求调剂 +5 jhx777 2026-03-27 5/250 2026-03-28 04:18 by fmesaito
[考研] 352分 化工与材料 +5 海纳百川Ly 2026-03-27 5/250 2026-03-28 03:39 by fmesaito
[考研] 一志愿南师大0703化学 275求调剂 +4 Ripcord上岸 2026-03-27 4/200 2026-03-27 17:00 by zhyzzh
[考研] 一志愿 西北大学 总分282 英语一62 求调剂 +7 18419759900 2026-03-25 8/400 2026-03-27 16:38 by 18419759900
[考研] 求调剂 一志愿 本科 北科大 化学 343 +6 13831862839 2026-03-24 7/350 2026-03-26 22:57 by 不吃魚的貓
[考研] 303求调剂 +6 蓝山月 2026-03-25 6/300 2026-03-25 22:47 by 418490947
[考研] 0854电子信息求调剂 +7 α____ 2026-03-22 9/450 2026-03-25 13:37 by α____
[考研] 347求调剂 +4 L when 2026-03-25 4/200 2026-03-25 13:37 by cocolv
[考研] 293求调剂 +7 加一一九 2026-03-24 7/350 2026-03-25 12:02 by userper
[考研] 求调剂 +6 研研，接电话 2026-03-24 7/350 2026-03-24 17:01 by barlinike
[考研] 材料专硕331求调剂 +4 鲜当牛 2026-03-24 4/200 2026-03-24 15:58 by JourneyLucky
[考研] 接收2026硕士调剂(学硕+专硕) +4 allen-yin 2026-03-23 6/300 2026-03-23 15:04 by 汪！？！
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭