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dulei

木虫 (小有名气)

[交流] DNA去磷酸化(CIAP)后怎么纯化?

我用的是CIAP碱性磷酸酶,照说明书的方法是这样的:
1、配制50uL反应体系。
2、37℃或50℃反应30分钟。
3、苯酚/氯仿/异戊醇(25 :24 :1)抽提2次。
4、氯仿/异戊醇(24 :1)抽提1次。
5、添加5 μl的3 M NaOAC。
6、添加125 μl的(2.5倍量)冷乙醇,在-20℃下保冷30~60分钟。
7、离心分离回收沉淀,用200 μl的70%冷乙醇洗净后,减压干燥。
8、用20μl以下的TE Buffer溶解沉淀。

可是,第7步离心,不管怎么离心都得不到沉淀!!(我用13000r/min,离心20min)。
请问高手们都是怎么弄得??希望给我个详细的步骤。谢谢!!

另外,我想在37℃反应30分钟后,不用3—8步的方法进行纯化,而用纯化试剂盒(例如EZ-10 Spin Column DNA Gel Extraction Kit),可不可以?谢谢!!
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zhaocy8903

木虫 (知名作家)

看不到沉淀不等于没有沉淀
用其他方法也可以
2楼2009-02-26 10:28:57
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mimisikai

金虫 (小有名气)

用kit吧
3楼2009-02-26 10:37:40
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qingxiong

木虫 (正式写手)

对,看不到沉淀不等于没有沉淀,用其它方法试试
4楼2009-02-26 13:53:42
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caoqishu

铜虫 (初入文坛)


不要按照说明书上的。以下是我平时做的步骤(先沉淀后去磷酸):
1.添加1/10体积的3 M NaOAC。
2.添加2倍无水乙醇,在-20℃下保冷过夜。
3.离心(12000rpm,15min),回收沉淀,用200 μl的70%冷乙醇洗净后,减压干燥。(一般情况都可以看到沉淀,如果没有也没关系,只是量少了点)
4.用20μl-50μl的ddH2O溶解沉淀。
5.配制40uL反应体系,37℃反应30分钟(酶加2μl),再加1μl酶50℃反应15分钟。
6.用回收试剂盒回收即可。
5楼2009-02-26 15:11:27
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guoqin_shiyin

银虫 (正式写手)

用NEB的热敏磷酸酶,据说是不需要沉淀的,加热就可以失活
6楼2009-02-26 16:23:12
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jasco

木虫 (正式写手)

直接用pcr产物回收试剂盒做
7楼2009-02-26 17:18:46
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小猫三两只

金虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by caoqishu at 2009-2-26 15:11:
不要按照说明书上的。以下是我平时做的步骤(先沉淀后去磷酸):
1.添加1/10体积的3 M NaOAC。
2.添加2倍无水乙醇,在-20℃下保冷过夜。
3.离心(12000rpm,15min),回收沉淀,用200 μl的70%冷乙醇洗净后, ...

去磷酸化后沉淀就跟一般沉淀DNA的方法是一样的,有时就会看不到沉淀,但不等于没有,只要倒酒精时小心一点不倒丢就行,可以接着往下做
8楼2009-02-26 18:05:19
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