应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 新药研发 » 临床研究 » 新技术分享！ATAC-seq新技术！
81/1返回列表
查看: 10845  |  回复: 7
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

omigen

捐助贵宾 (初入文坛)

[交流] 新技术分享！ATAC-seq新技术！

今天给大家介绍一下通过高通量测序技术助力新药研发的新技术！ATAC-seq是通过使用高通量测序对转座酶可接近性核染色质区域进行分析（Assay for Transposase-Accessible Chromatin with high throughput sequencing）的一种创新表观遗传学研究技术。该技术通过转座酶对某种特定时空下开放的核染色质区域进行切割，进而获得在该特定时空下基因组中所有活跃转录的调控序列。
新技术分享！ATAC-seq新技术！
真核细胞通过将基因组DNA与组蛋白进行不同层次的折叠组装成染色质，这些精密组装信息在基因转录调控中起决定性作用。染色质区域的可接近性是特异性反式作用因子和顺式调控元件相互作用的前提，基因表达的异常或者染色质调控因子的改变都将对细胞的命运产生深远的影响，进而导致各种疾病的发生、发展。目前该技术已被广泛应用于转录调控序列的鉴定。
ATAC-seq技术应用领域：
1.        重大疾病发病机制
2.        药物作用机制
3.        新药研发
4.        生物标志物功能研究
而将ATAC-seq和RNA-seq整合基因组学研究进行整合研究，将会获得对生物体（动物或植物）中的转录调控机制。通过ATAC-seq技术可以获得细胞在某特定时空下所有染色质展开区域的信息，可用于检测所有在该条件下发生转录的基因及其顺式调控元件；通过RNA-seq技术则可获得细胞在该特定时空下所有的转录本信息；将两者数据相整合则可推断相关基因上游的顺式调控序列，宏观分析细胞在该特定时空下整个基因组的调控网络。同时ATAC-seq测得的数据能更好的支撑和解释RNA-seq测得的数据，更为精确地探索基因高表达和低表达的转录调控机制。这一策略可以广泛应用于不同类型的细胞分化，肿瘤发生发展，以及胚胎发育等生物学过程的研究。
该技术在国外已经研究应用比在国内更加广泛，目前国内对于该技术的应用还是不是很多，但是，运用该技术发表高分文章的机会是很大的。比如《Nature》中发表的题目为“The landscape of accessible chromatin in mammalian preimplantation embryos”的文章影响因子为40.137，《Immunity》中发表的“Dynamic Changes in Chromatin Accessibility Occur in CD8+ T Cells Responding to Viral Infection”影响因子为22.844。
回复此楼

» 猜你喜欢

» 抢金币啦！回帖就可以得到:

查看全部散金贴
1楼 2017-09-20 10:28:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

oxword

新虫 (初入文坛)
★
omigen(金币+1): 谢谢参与
不错
回复此楼
2楼2017-12-12 16:13:59
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

drwhoknowss

荣誉版主 (正式写手)
★
omigen(金币+1): 谢谢参与
这两年很多人开始用了
赞一下 回复此楼
3楼2018-01-25 11:34:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhouxueysq

新虫 (初入文坛)
★
omigen(金币+1): 谢谢参与
有成熟的实验方法和步骤吗
赞一下 回复此楼
5楼2018-06-13 11:42:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

diatrexue5

新虫 (初入文坛)
★
omigen(金币+1): 谢谢参与
目前已经很成熟了，有公司（www.diatre.com）有ATAC kit,即Assay for Transposase-Accessible Chromatin（ATAC）Library Prep Kit for Illumina，可解决冻存对结果影响。
赞一下 回复此楼
6楼2018-09-26 20:40:52
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

diatrexue5

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
5楼: Originally posted by zhouxueysq at 2018-06-13 11:42:55
有成熟的实验方法和步骤吗

目前已经很成熟了，有公司（www.diatre.com）有ATAC kit,即Assay for Transposase-Accessible Chromatin（ATAC）Library Prep Kit for Illumina，可解决冻存对结果影响。
赞一下 回复此楼
7楼2018-09-26 20:42:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
简单回复
wdxmu4楼
2018-01-25 17:12   回复  
露和水8楼
2018-09-26 22:44   回复  
omigen(金币+1): 谢谢参与
赞 发自小木虫Android客户端
相关版块跳转 我要订阅楼主 omigen 的主题更新
81/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 人工智能320调剂08工类还有机会吗 +12 振—TZ 2026-04-10 12/600 2026-04-12 07:54 by wj165256
[考研] 一志愿新疆大学085401，314分 +4 咔咔咔咔9 2026-04-05 4/200 2026-04-12 02:21 by 秋豆菜芽
[找工作] 山东高校教师考核超级无底线，员工过不下去啦 +4 qut2026 2026-04-09 9/450 2026-04-12 00:54 by qut2026
[考研] 求调剂 +6 小聂爱学习 2026-04-11 9/450 2026-04-11 21:20 by 蓝云思雨
[考研] 270求调剂 +14 杨乐369 2026-04-11 14/700 2026-04-11 20:16 by 蓝云思雨
[考研] 计算机11408，286分求调剂 +10 木子念晞 2026-04-05 10/500 2026-04-11 10:44 by zhq0425
[考研] 296求调剂 +13 汪！？！ 2026-04-10 15/750 2026-04-11 10:31 by 逆水乘风
[材料工程] 材料调剂推荐 +8 蛋糕x2 2026-04-07 8/400 2026-04-10 23:13 by Ftglcn90
[考研] 调剂 +19 小张ZA 2026-04-10 20/1000 2026-04-10 22:08 by 猪会飞
[考研] 362求调剂 +10 我要考大 2026-04-06 14/700 2026-04-10 17:00 by luoyongfeng
[考研] 277求调剂 +19 倪建设 2026-04-06 19/950 2026-04-10 09:24 by guosr9609
[考研] 085601初试330分找调剂 +10 流心奶黄包l 2026-04-09 10/500 2026-04-10 08:14 by Sammy2
[考研] 085600材料与化工，求调剂 +11 won_qii 2026-04-07 11/550 2026-04-09 17:03 by luoyongfeng
[考研] 286求调剂 +19 Faune 2026-04-08 20/1000 2026-04-09 08:36 by 哦哦123
[考研] 一志愿南京航空航天大学 材料与化工329分求调剂 +11 Mr. Z 2026-04-05 12/600 2026-04-08 16:15 by luoyongfeng
[考研] 326分，一志愿沪9，求生物学调剂 +4 刘墨墨 2026-04-05 4/200 2026-04-08 06:22 by lijunpoly
[考研] 求考研材料调剂 +3 材化李可 2026-04-07 3/150 2026-04-08 00:21 by JourneyLucky
[考研] 信工所11408 340分 本科西安交大自动化 +3 moontrek 2026-04-06 3/150 2026-04-07 09:56 by chongya
[考研] 生物与医药求调剂 +7 heguanhua 2026-04-05 8/400 2026-04-06 18:41 by macy2011
[考研] 机械专硕274求调剂，不挑专业学校 +6 泛泛2333 2026-04-05 8/400 2026-04-06 18:06 by 泛泛2333
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭