| 查看: 10848 | 回复: 7 | |||
[交流]
新技术分享！ATAC-seq新技术！
|
|||
今天给大家介绍一下通过高通量测序技术助力新药研发的新技术！ATAC-seq是通过使用高通量测序对转座酶可接近性核染色质区域进行分析（Assay for Transposase-Accessible Chromatin with high throughput sequencing）的一种创新表观遗传学研究技术。该技术通过转座酶对某种特定时空下开放的核染色质区域进行切割，进而获得在该特定时空下基因组中所有活跃转录的调控序列。 真核细胞通过将基因组DNA与组蛋白进行不同层次的折叠组装成染色质，这些精密组装信息在基因转录调控中起决定性作用。染色质区域的可接近性是特异性反式作用因子和顺式调控元件相互作用的前提，基因表达的异常或者染色质调控因子的改变都将对细胞的命运产生深远的影响，进而导致各种疾病的发生、发展。目前该技术已被广泛应用于转录调控序列的鉴定。 ATAC-seq技术应用领域： 1. 重大疾病发病机制 2. 药物作用机制 3. 新药研发 4. 生物标志物功能研究 而将ATAC-seq和RNA-seq整合基因组学研究进行整合研究，将会获得对生物体（动物或植物）中的转录调控机制。通过ATAC-seq技术可以获得细胞在某特定时空下所有染色质展开区域的信息，可用于检测所有在该条件下发生转录的基因及其顺式调控元件；通过RNA-seq技术则可获得细胞在该特定时空下所有的转录本信息；将两者数据相整合则可推断相关基因上游的顺式调控序列，宏观分析细胞在该特定时空下整个基因组的调控网络。同时ATAC-seq测得的数据能更好的支撑和解释RNA-seq测得的数据，更为精确地探索基因高表达和低表达的转录调控机制。这一策略可以广泛应用于不同类型的细胞分化，肿瘤发生发展，以及胚胎发育等生物学过程的研究。 该技术在国外已经研究应用比在国内更加广泛，目前国内对于该技术的应用还是不是很多，但是，运用该技术发表高分文章的机会是很大的。比如《Nature》中发表的题目为“The landscape of accessible chromatin in mammalian preimplantation embryos”的文章影响因子为40.137，《Immunity》中发表的“Dynamic Changes in Chromatin Accessibility Occur in CD8+ T Cells Responding to Viral Infection”影响因子为22.844。 |
回复此楼» 猜你喜欢
江西科技师范大学07生物学和08生物与医药
已经有28人回复
-
【招聘】清北（济南）生物科技招聘AI制药研发计算人才
已经有18人回复
-
药物学论文润色/翻译怎么收费?
已经有106人回复
-
考研调剂：国家蛋白质科学中心（国家重点实验室）和安徽医科大学基础医学院联培
已经有4人回复
-
100701药学专业招调剂，5个名额，药物化学专业，主要是天然药物化学方向加药理
已经有4人回复
-
华南理工大学 基础医学学硕和临床医学学硕调剂
已经有11人回复
-
【2026 硕士调剂】 全国重点实验室 药学 化学 生物学 生物与医药
已经有0人回复
-
药学 化学 生物学 生物与医药 河南师范大学抗病毒性传染病创新药物全国重点实验室
已经有0人回复
-
江西师大化学工程学院调剂今晚0点开放！ 缺额100个，速冲！
已经有13人回复
» 抢金币啦！回帖就可以得到:
-
2007年一起玩耍的老虫子们，想死你们啦~~~出来冒个泡吧……
+1/162
-
★★精品★★0860生物与医药还有调剂指标，最后的机会，捡漏上岸
+1/131
-
华南理工大学微电子学院招博士研究生
+1/91
-
哈尔滨工程大学核动力装置研究所招收1-2名博士生
+1/88
-
中医药广东省实验生物成像团队调剂信息
+1/41
-
国家兴奋剂检测上海实验室--硕士接收化学、药学、生物学、中药学等专业接收调剂6人
+1/39
-
山西大学光量子技术与器件国家实验室招收物理、光学、材料专业2026级博士、硕士研究生
+1/38
-
哈尔滨理工大学0805材料科学与工程、0856材料与化工、0703化学，接收调剂
+1/38
-
调剂系统即将关闭-广西大学农学院硕士研究生调剂（报考专业为09开头）
+2/36
-
省重点实验室招收调剂生（一志愿07开头专业），海洋生物专业名额充足
+1/21
-
浙江理工大学蒋仲庆教授课题组招收物理或者材料背景研究生（调剂1名）
+1/18
-
沈阳工业大学石油化工学院传质强化研究团队招收硕士研究生调剂
+1/17
-
香港科技大学（广州）杨其纯课题组招收水文学方向博士后研究人员两名
+1/12
-
做流体实验还在凑设备？这套高精密流场可视化方案真的适合高校吗？
+1/11
-
Postdoc position in continuum mechanics of brain tissue at KTH
+1/5
-
武汉工程大学化学与环境工程学院招收调剂学生
+1/4
-
海南医科大学智能医学课题组招收生物信息学方向专业硕士研究生！
+1/3
-
淮北师范大学能源科学与工程学院研究生招收调剂
+1/2
-
湖南农业大学能源材料创新团队招收2026化学专业研究生（学硕）调剂
+1/2
-
鲁东大学水产学院杨建敏教授课题组，2026年水产学硕接收调剂3-4人
+1/2
2楼2017-12-12 16:13:59
3楼2018-01-25 11:34:37
5楼2018-06-13 11:42:55
6楼2018-09-26 20:40:52
7楼2018-09-26 20:42:25
简单回复
wdxmu4楼
2018-01-25 17:12
回复
露和水8楼
2018-09-26 22:44
回复
omigen(金币+1): 谢谢参与
赞 发自小木虫Android客户端
