| 查看: 10792 | 回复: 7 | |||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | |||
[交流]
新技术分享！ATAC-seq新技术！
|
|||
今天给大家介绍一下通过高通量测序技术助力新药研发的新技术！ATAC-seq是通过使用高通量测序对转座酶可接近性核染色质区域进行分析（Assay for Transposase-Accessible Chromatin with high throughput sequencing）的一种创新表观遗传学研究技术。该技术通过转座酶对某种特定时空下开放的核染色质区域进行切割，进而获得在该特定时空下基因组中所有活跃转录的调控序列。 真核细胞通过将基因组DNA与组蛋白进行不同层次的折叠组装成染色质，这些精密组装信息在基因转录调控中起决定性作用。染色质区域的可接近性是特异性反式作用因子和顺式调控元件相互作用的前提，基因表达的异常或者染色质调控因子的改变都将对细胞的命运产生深远的影响，进而导致各种疾病的发生、发展。目前该技术已被广泛应用于转录调控序列的鉴定。 ATAC-seq技术应用领域： 1. 重大疾病发病机制 2. 药物作用机制 3. 新药研发 4. 生物标志物功能研究 而将ATAC-seq和RNA-seq整合基因组学研究进行整合研究，将会获得对生物体（动物或植物）中的转录调控机制。通过ATAC-seq技术可以获得细胞在某特定时空下所有染色质展开区域的信息，可用于检测所有在该条件下发生转录的基因及其顺式调控元件；通过RNA-seq技术则可获得细胞在该特定时空下所有的转录本信息；将两者数据相整合则可推断相关基因上游的顺式调控序列，宏观分析细胞在该特定时空下整个基因组的调控网络。同时ATAC-seq测得的数据能更好的支撑和解释RNA-seq测得的数据，更为精确地探索基因高表达和低表达的转录调控机制。这一策略可以广泛应用于不同类型的细胞分化，肿瘤发生发展，以及胚胎发育等生物学过程的研究。 该技术在国外已经研究应用比在国内更加广泛，目前国内对于该技术的应用还是不是很多，但是，运用该技术发表高分文章的机会是很大的。比如《Nature》中发表的题目为“The landscape of accessible chromatin in mammalian preimplantation embryos”的文章影响因子为40.137，《Immunity》中发表的“Dynamic Changes in Chromatin Accessibility Occur in CD8+ T Cells Responding to Viral Infection”影响因子为22.844。 |
回复此楼» 猜你喜欢
药学专硕调剂
已经有0人回复
-
药学调剂申请自荐信，一志愿中南大学
已经有1人回复
-
药物学论文润色/翻译怎么收费?
已经有64人回复
-
药学349专硕求调剂
已经有1人回复
-
publcif的使用
已经有0人回复
-
求调剂
已经有2人回复
-
会计专硕求调剂
已经有0人回复
-
《左乙拉西坦注射液制备工艺研究、质量控制和稳定性研究》下载
已经有1人回复
-
新加坡国立大学药学系化学生物学课题组招PhD
已经有14人回复
-
请教酰胺缩合反应
已经有1人回复
» 抢金币啦！回帖就可以得到:
-
济南大学林秀娟教授招收材料类博士生
+1/85
-
招收材料与化学相关专业硕士研究生
+1/84
-
海南大学化工院生物质定向转化课题组招收博士/硕士，2026年9月入学
+1/82
-
坐标广州，男征女，双向奔赴
+1/66
-
西北大学化学与材料科学学院博士招生（还有两个名额，3月30日截至）
+1/63
-
湘潭大学化工学院国家级人才团队2026年博士研究生招生
+1/60
-
下周见一个合作者，应该问些什么
+1/29
-
浙江中医药大学副校长团队招聘药学/生物信息学等方向高校教师7名，报名通道已开启
+1/17
-
---大龄的未婚男找结婚女对象
+1/17
-
【预硕】【预博】青岛大学生物医药创新转化
+1/15
-
南京林业大学-国家级青年人才团队 招2026级申请考核制博士（合成化学、植物化学方向）
+1/14
-
南昌一本市政工程接受调剂
+1/14
-
中国中医科学院中医药健康产业研究所（江西中医药健康产业研究院）2026年高层次人才等
+1/11
-
青岛科技大学化工学院院士团队2026年拟招收全日制博士研究生1名
+1/9
-
211/双一流---石河子大学---有机化学方向招调剂生
+1/7
-
国家级人才团队诚聘生物信息相关专业的科研助理
+1/5
-
211/双一流石河子大学化学化工学院--电催化，CO2转化
+1/3
-
求调剂｜一志愿广东工业大学控制工程｜总分355｜本科电气｜有项目/竞赛/论文经历
+1/3
-
深圳大学蔡兴科课题组博士后及研究助理招聘
+1/2
-
武汉纺织大学纺织纤维及制品教育部重点实验室招收博士研究生
+1/2
3楼2018-01-25 11:34:37
5楼2018-06-13 11:42:55
6楼2018-09-26 20:40:52
7楼2018-09-26 20:42:25
简单回复
wdxmu4楼
2018-01-25 17:12
回复
露和水8楼
2018-09-26 22:44
回复
omigen(金币+1): 谢谢参与
赞 发自小木虫Android客户端
