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齐国小药童

木虫 (著名写手)

[交流] 大肠杆菌和金黄色葡萄球菌的生长曲线求教已有6人参与

最近做一个实验项目,验证之前做出的消毒液对于大肠杆菌和金黄色葡萄球菌的杀菌效果。我的思路是:绘制大肠杆菌和金黄色葡萄球菌的生长曲线,通过酶标仪测量OD600值,找出细菌生长的对数期,然后把这个时期的菌悬液与我的消毒液作用,看看杀菌效果,既然对数期都能有很好的杀菌效果,那么这个消毒液的杀菌效果就好。
具体做法是:从平板里接种一环大肠杆菌和金黄色葡萄球菌的单菌落于20ml装有MH肉汤的试管中。放到摇床去摇。37℃。每隔两小时取一次样。空白对照组用的是MH肉汤。
结果发现经过40h,所测得的OD值偏小。40h大肠杆菌的的OD值是0.33左右,金黄色葡萄球菌的OD值是0.27左右。而且OD值的增加也是不紧不慢,每次也就增加0.02而已。
请教各位网友造成OD值偏小的原因是什么呢?是用的液体培养基不可以?或者是往96孔板中加样的时候加了100ul,加样量少?
现在金黄色葡萄球菌的试管底部都有沉淀产生了。OD值也不增加了。对数期应该是过了,但是看数据发现第十八小时的时候OD值增加的最多,比前一次增加0.05.增加后的OD值是0.13但是也是偏小吧。对数期的od值是不是要达到0.6呢?
请各位大神不吝赐教,谢谢!!!

大肠杆菌和金黄色葡萄球菌的生长曲线求教
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大肠杆菌和金黄色葡萄球菌的生长曲线求教-1
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我就是我,是颜色不一样的焰火
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snoopytbw

荣誉版主 (著名写手)


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这个实验设计问题太多了,首先,没有阳性对照!
其次,你的菌浓度初始值都没有测OD值么,必须做至少3-5组平行组啊,最好多做点,取平均值。初始值我觉得还是偏高的,一般开始的菌浓度我都是用的麦氏0.5左右。
第三,用MH培养基做金葡,效果不会太好,建议用LB,大肠也是!
第四,试管法培养是摇不了的,你用超过150RPM,试管都放不稳。。。建议用微量板做!不是96孔板,有微生物用的那种板,里面是半圆形的小孔,可以试试。用板的话,就不需要摇了,做一排平行对照,每次测定的时候用掉一孔。
第五,你这个方法测定OD,显然是错误的,每次取一点,体积就小了,然后初始体积和最终体积会差很多!
第六,杀菌剂浓度梯度都没做。。。。。要做微量稀释法的。。。!!!!!
4楼2017-08-22 09:02:14
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主语

木虫 (小有名气)


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我的金葡抑菌实验是这样做的:
1.取单菌落至~3 ml TSB培养基(用50mlEP 管就行),37℃~14 h,
2.20倍稀释(50ul菌液至950ul TSB培养基),用TSB培养基调零,(此时OD600大概在0.4-0.6,如果不是,稀释至0.5左右)
3.将原菌液稀释至OD600为0.5,约为4ml左右,加入相应浓度的药物,至37℃摇床,每2h取一次样(50ul菌液至950ul TSB培养基),测
OD600,同时设置对照(即原菌液稀释至OD600为0.5,约为4ml左右,不加药物),此时已然要用TSB培养基调零,
始于足下
8楼2017-08-23 14:35:14
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snoopytbw

荣誉版主 (著名写手)


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引用回帖:
7楼: Originally posted by 齐国小药童 at 2017-08-23 12:20:23
谢谢解答。我想还是做几个平行吧,我想再请教您:1.如果我要每隔两小时测定一下,一共测24h的话,这样就得取12个点,是不是应该做12组平行呢?然后到点从这12组里任取三组或5组测一下OD值求平均数,而不是从这12组里 ...

1. 其实我觉得可以做6个组,每次测,可以挑取3个测。随机化挑取。可以用随机函数,excel就行。初始值的问题,你可以在流式管里面配好母液,每组加一样的就好了啊。
2. 初始值,你自己定,没必要按我的。这个反正定量即可。
3. 阳性对照,就是不加灭菌纳米颗粒的。
4. 稀释倍比,作用其实就是评估,你的杀菌纳米颗粒最小抑菌值。可以评价其杀菌效果的。梯度可以母液为1,依次稀释,看你实验结果了,这个要做预实验的。最好符合正态分布,这样好统计分析。
9楼2017-08-24 08:42:57
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雨季001

新虫 (小有名气)


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试管里放这么多,菌能摇起来?不是应该在小的锥形瓶里吗

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2楼2017-08-20 23:13:52
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齐国小药童

木虫 (著名写手)

引用回帖:
12楼: Originally posted by 李素贞 at 2017-09-04 08:19:08
大佬,想问问通过测OD值如何找对数期?
...

测完OD值后,以时间为横坐标,OD值为纵坐标作图。所有的取样点连接起来,这条线上斜率最大的那段时间就是对数生长期了。之前有人告诉我说对数生长期的OD值为多少多少,其实这样说也不准确,毕竟不同的菌,不同仪器监测,和个人操作的不同都会导致OD有偏差。所以还是得自己做完自己找。
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13楼2017-09-04 09:32:20
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齐国小药童

木虫 (著名写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 雨季001 at 2017-08-20 23:13:52
试管里放这么多,菌能摇起来?不是应该在小的锥形瓶里吗

谢谢您的建议,那我用锥形瓶再摇一下试试。还有我想问一下,往九十六孔板里面加样量是100ul好呢还是200ul好呢?
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3楼2017-08-21 08:38:43
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齐国小药童

木虫 (著名写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by snoopytbw at 2017-08-22 09:02:14
这个实验设计问题太多了,首先,没有阳性对照!
其次,你的菌浓度初始值都没有测OD值么,必须做至少3-5组平行组啊,最好多做点,取平均值。初始值我觉得还是偏高的,一般开始的菌浓度我都是用的麦氏0.5左右。
第三 ...

非常感谢您的建议和指正!请问我测出菌液的OD值是不是要减去空白对照的OD值呢?微量板我们实验室好像没有,我可以用锥形瓶摇么?还有针对您说的第五条,我该如何操作来避免体积减小的问题呢?
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5楼2017-08-23 09:25:28
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snoopytbw

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引用回帖:
5楼: Originally posted by 齐国小药童 at 2017-08-23 09:25:28
非常感谢您的建议和指正!请问我测出菌液的OD值是不是要减去空白对照的OD值呢?微量板我们实验室好像没有,我可以用锥形瓶摇么?还有针对您说的第五条,我该如何操作来避免体积减小的问题呢?...

对的,实验组需要减去空白OD。
避免体积损失的方法,很多。可以用半连续培养法,也可以用大一点的锥形瓶比如1L的,每次你用无菌移液管,只吸取1ml以内,用酶标板测OD,貌似200ul就够了,这样损失几乎可以忽略。当然我只不过举例,也没必要真的用1L体积。。不过我还是建议你多做几个平行,这样准一点。
半连续培养法,其实就是定期转移一定量的菌液进入新的体系里面,做出来的生长曲线略平,貌似可以修正的。其实差别不会太大,你想相当于每次转移掉你需要测OD的体积,然后补一点进去。分母位置差别不大,不过时间长了会有的差异的,可以用罗氏曲线函数回归修正

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6楼2017-08-23 11:19:30
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齐国小药童

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6楼: Originally posted by snoopytbw at 2017-08-23 11:19:30
对的,实验组需要减去空白OD。
避免体积损失的方法,很多。可以用半连续培养法,也可以用大一点的锥形瓶比如1L的,每次你用无菌移液管,只吸取1ml以内,用酶标板测OD,貌似200ul就够了,这样损失几乎可以忽略。当 ...

谢谢解答。我想还是做几个平行吧,我想再请教您:1.如果我要每隔两小时测定一下,一共测24h的话,这样就得取12个点,是不是应该做12组平行呢?然后到点从这12组里任取三组或5组测一下OD值求平均数,而不是从这12组里面任取1组测3次或5次求平均值,这思路对么?可是这12组平行一开始接种菌的数量也会有差异吧,这也有误差。2.还有您说的,我应该是从菌浓度达到0.5麦氏单位(也就是OD值0.13-0.15左右)时才开始计算时间对么?3.您说的阳性对照组是测OD值时设定的阳性对照组么?4.我将消毒剂(4.5ml)与菌液(0.5ml)混合后1min,2min,5min,10min,随后取混合液1ml于培养皿中,倒入琼脂培养基,待凝固后,放入恒温培养箱,48h后看实验结果。(阳性对照组就是菌悬液,阴性对照组是中和剂)我是想用这种思路来进行实验。这样的话依然要做杀菌剂浓度梯度稀释对么?稀释的话要稀释多少倍呢?望大神不吝赐教,谢谢!
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7楼2017-08-23 12:20:23
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齐国小药童

木虫 (著名写手)

引用回帖:
8楼: Originally posted by 主语 at 2017-08-23 14:35:14
我的金葡抑菌实验是这样做的:
1.取单菌落至~3 ml TSB培养基(用50mlEP 管就行),37℃~14 h,
2.20倍稀释(50ul菌液至950ul TSB培养基),用TSB培养基调零,(此时OD600大概在0.4-0.6,如果不是,稀释至0.5左右) ...

1.请问用TSB培养基培养金葡菌效果好么?2.第一步37℃培养14h是在恒温培养箱么?我想做它们的生长曲线也是为了给我的实验增加点任务量,为了顺利毕业 - -。其实如您说所,只要我培养到他们的OD值达到0.5左右,就已经认为是对数期了。3.第三部加入药物做梯度了么?每隔两小时取一次样,一共取了几个样呀?实验结果可好?
非常感谢主语同学码了这么多字给我解答,而且这个抑菌试验方法也很好。
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10楼2017-08-24 09:52:42
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