24小时热门版块排行榜    

查看: 1856  |  回复: 20

Melody灬绝仙

新虫 (初入文坛)

[求助] 反向PCR 测序失败 已有2人参与

经历了几个月的摸索,终于能够扩增出来条带了,可是现在卡在了测序这一步,说是杂带太多。

本人按照一般的反向PCR操作,先使用  EcoR I   和   Hind III   来双酶切基因组,回收之后  T4 连接酶连接,再次回收,使用Takara公司的PrimeSTAR GXL酶来进行反向PCR扩增,结果扩得条带,之前使用PMD18-T载体一直没有连接上,所以直接送PCR回收产物去测序,可是一直是杂带太多,无法测序。各位大牛有没有什么好的建议给小弟。附一张PCR图

反向PCR     测序失败
IMG_20170730_180705.jpg
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Melody灬绝仙

新虫 (初入文坛)

marker是DL10000,前面2个是PCR产物,后面依次是基因组、酶切产物、环化产物
2楼2017-08-01 17:20:49
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhouxfd

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2017-08-02 07:44:26
PCR产物由于不纯所以不好测序,将产物回收后用taq酶处理链接T载体后再测序
3楼2017-08-02 01:00:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

linminchia

新虫 (初入文坛)

請問用雙酶切之後,再用T4連接回原?淼幕蚪M?目的是什麼

发自小木虫IOS客户端
4楼2017-08-02 04:05:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Melody灬绝仙

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by zhouxfd at 2017-08-02 01:00:21
PCR产物由于不纯所以不好测序,将产物回收后用taq酶处理链接T载体后再测序

用taq酶处理?没有怎么理解这一步的意思,能具体说说么
5楼2017-08-02 08:37:36
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

六维空想

新虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by Melody灬绝仙 at 2017-08-02 08:37:36
用taq酶处理?没有怎么理解这一步的意思,能具体说说么...

taq酶加a 要不然连不上t载体

发自小木虫Android客户端
6楼2017-08-02 11:59:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Melody灬绝仙

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
6楼: Originally posted by 六维空想 at 2017-08-02 11:59:32
taq酶加a 要不然连不上t载体
...

噢噢,这个我倒是知道,就是加一个A尾,我是想问怎么操作呢,将PCR产物切胶回收后,然后怎么加taq?有详细点的步骤或是相关的文献么?

发自小木虫Android客户端
7楼2017-08-02 12:47:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

六维空想

新虫 (小有名气)

我是直接未纯化的pcr产物补加taq酶体系 72℃半个小时

发自小木虫Android客户端
8楼2017-08-02 16:03:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zyfskj

新虫 (著名写手)

你用的酶扩增后有没有加polyA尾巴?

发自小木虫IOS客户端
向我乞求怜悯吧,我会狠狠拒绝的。
9楼2017-08-02 16:57:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zyfskj

新虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
引用回帖:
7楼: Originally posted by Melody灬绝仙 at 2017-08-02 12:47:04
噢噢,这个我倒是知道,就是加一个A尾,我是想问怎么操作呢,将PCR产物切胶回收后,然后怎么加taq?有详细点的步骤或是相关的文献么?
...

Takara有TA克隆试剂盒

发自小木虫IOS客户端
向我乞求怜悯吧,我会狠狠拒绝的。
10楼2017-08-02 16:57:40
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 Melody灬绝仙 的主题更新
信息提示
请填处理意见