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2017453

新虫 (初入文坛)

[交流] 质谱 蛋白片段 已有2人参与

拟南芥蛋白质组学多肽片段搜库后,出现的的40条多肽链中,有大量氨基酸G,如图。
当然,还有30条多肽是正常的,如图二。请问多肽中出现大量G是搜库问题 还是搜库设置问题 ,或者是实验操作问题 是否需要重新搜库?求高人解答

质谱 蛋白片段


质谱 蛋白片段-1


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proteomicszj

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首先是你搜库用的那个库?

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2楼2017-07-06 16:10:16
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2017453

新虫 (初入文坛)

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2楼: Originally posted by proteomicszj at 2017-07-06 16:10:16
首先是你搜库用的那个库?

拟南芥蛋白库 难道是搜库出现了问题

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3楼2017-07-06 18:01:51
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proteomicszj

新虫 (小有名气)


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3楼: Originally posted by 2017453 at 2017-07-06 18:01:51
拟南芥蛋白库 难道是搜库出现了问题
...

拟南芥本来就含有polyG的蛋白。
4楼2017-07-07 08:49:42
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苜蓿

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4楼: Originally posted by proteomicszj at 2017-07-07 08:49:42
拟南芥本来就含有polyG的蛋白。...

那你的意思这是正常的吗

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5楼2017-07-07 09:01:02
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苜蓿

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2楼: Originally posted by proteomicszj at 2017-07-06 16:10:16
首先是你搜库用的那个库?

拟南芥蛋白质组搜库搜的特别慢,正常吗

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6楼2017-07-07 18:05:40
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proteomicszj

新虫 (小有名气)


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6楼: Originally posted by 苜蓿 at 2017-07-07 18:05:40
拟南芥蛋白质组搜库搜的特别慢,正常吗
...

如果只有一个文件,不找特殊的翻译后修饰,一般一两个小时够。
7楼2017-07-07 20:25:17
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