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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 蛋白/酶 » 质谱 蛋白片段
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2017453

新虫 (初入文坛)

[交流] 质谱 蛋白片段 已有2人参与

拟南芥蛋白质组学多肽片段搜库后，出现的的40条多肽链中，有大量氨基酸G,如图。
当然，还有30条多肽是正常的，如图二。请问多肽中出现大量G是搜库问题 还是搜库设置问题 ，或者是实验操作问题 是否需要重新搜库?求高人解答

质谱 蛋白片段


质谱 蛋白片段-1


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1楼 2017-07-06 10:16:29
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proteomicszj

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首先是你搜库用的那个库？
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苜蓿
2楼2017-07-06 16:10:16
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2017453

新虫 (初入文坛)
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2楼: Originally posted by proteomicszj at 2017-07-06 16:10:16
首先是你搜库用的那个库？

拟南芥蛋白库 难道是搜库出现了问题

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3楼2017-07-06 18:01:51
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proteomicszj

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3楼: Originally posted by 2017453 at 2017-07-06 18:01:51
拟南芥蛋白库 难道是搜库出现了问题
...

拟南芥本来就含有polyG的蛋白。
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4楼2017-07-07 08:49:42
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苜蓿

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4楼: Originally posted by proteomicszj at 2017-07-07 08:49:42
拟南芥本来就含有polyG的蛋白。...

那你的意思这是正常的吗

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5楼2017-07-07 09:01:02
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苜蓿

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2楼: Originally posted by proteomicszj at 2017-07-06 16:10:16
首先是你搜库用的那个库？

拟南芥蛋白质组搜库搜的特别慢，正常吗

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6楼2017-07-07 18:05:40
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proteomicszj

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6楼: Originally posted by 苜蓿 at 2017-07-07 18:05:40
拟南芥蛋白质组搜库搜的特别慢，正常吗
...

如果只有一个文件，不找特殊的翻译后修饰，一般一两个小时够。
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7楼2017-07-07 20:25:17
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