24小时热门版块排行榜    

北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
查看: 1385  |  回复: 5

相见很不晚

新虫 (初入文坛)

[求助] 16s rna 如何对otu表进行拉平处理

各位好,请问一下 ,就是我们在做alpha多样性之前,需要对otu表根据最低测序深度进行随机重抽样,即拉平处理,我知道qiime中的parallel_multiple_rarefactions.py可以实现otu矩阵稀疏化,并会输出好几个稀疏化的文件,公司说可以通过R软件对多次稀疏化结果取均值,得到最终的拉平后的otu矩阵。请问这里的取均值是什么意思,就是多个表格中重复出现的么?
    下面是其中一个稀疏化后得到的otu表,假如有10个这种表的化应如何取均值?希望各位能贴一下脚本16s rna  如何对otu表进行拉平处理
Y6YLS3MABA1X$HOO(80B19O.png
回复此楼

» 本帖附件资源列表

  • 欢迎监督和反馈:小木虫仅提供交流平台,不对该内容负责。
    本内容由用户自主发布,如果其内容涉及到知识产权问题,其责任在于用户本人,如对版权有异议,请联系邮箱:xiaomuchong@tal.com
  • 附件 1 : rarefaction_5640_0.txt
  • 2017-06-05 21:12:22, 3.29 M

» 猜你喜欢

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
2楼2017-08-18 09:24:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
3楼2017-08-18 17:09:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
4楼2017-08-19 17:04:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
5楼2017-08-20 09:26:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
6楼2017-08-21 00:58:59
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 相见很不晚 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 275求调剂 +8 jjjjjjjjjjl 2026-03-27 8/400 2026-03-27 19:40 by yhmsz
[考研] 085602 307分 求调剂 +5 不知道叫什么! 2026-03-26 5/250 2026-03-27 19:20 by 无际的草原
[有机交流] 高温高压反应求助 10+3 chibby 2026-03-25 3/150 2026-03-27 19:18 by pin4501
[考研] 285求调剂 +3 AZMK 2026-03-27 5/250 2026-03-27 18:09 by AZMK
[考研] 289求调剂 +7 新时代材料 2026-03-27 7/350 2026-03-27 18:08 by arrow8852
[考研] 340求调剂 +4 jhx777 2026-03-27 4/200 2026-03-27 16:50 by sanrepian
[考研] 一志愿 西北大学 总分282 英语一62 求调剂 +7 18419759900 2026-03-25 8/400 2026-03-27 16:38 by 18419759900
[考研] 307求调剂 +8 超级伊昂大王 2026-03-24 9/450 2026-03-27 15:34 by 超级伊昂大王
[考研] 一志愿陕师大生物学071000,298分,求调剂 +5 SYA! 2026-03-23 5/250 2026-03-27 09:29 by 不吃魚的貓
[考研] 304材料求调剂 +4 钟llll 2026-03-26 4/200 2026-03-27 03:42 by wxiongid
[考研] 341求调剂 +7 青柠檬1 2026-03-26 7/350 2026-03-27 00:19 by wxiongid
[考研] 333求调剂 +6 wfh030413@ 2026-03-23 6/300 2026-03-26 22:45 by 学员8dgXkO
[考研] 0856求调剂 +8 zhn03 2026-03-25 9/450 2026-03-26 13:42 by zzll406
[考研] 309求调剂 +4 gajsj 2026-03-25 5/250 2026-03-26 00:27 by Dyhoer
[考研] 求b区院校调剂 +4 周56 2026-03-24 5/250 2026-03-25 17:12 by yishunmin
[考研] 材料调剂 +3 iwinso 2026-03-23 3/150 2026-03-25 11:29 by greychen00
[考研] 材料专硕331求调剂 +4 鲜当牛 2026-03-24 4/200 2026-03-24 15:58 by JourneyLucky
[考研] 一志愿重庆大学085700资源与环境,总分308求调剂 +7 墨墨漠 2026-03-23 8/400 2026-03-23 20:36 by Creta
[考研] 333求调剂 +3 ALULU4408 2026-03-23 3/150 2026-03-23 19:04 by macy2011
[考研] 306求调剂 +5 来好运来来来 2026-03-22 5/250 2026-03-22 16:17 by BruceLiu320
信息提示
请填处理意见