24小时热门版块排行榜    

查看: 1382  |  回复: 5

相见很不晚

新虫 (初入文坛)

[求助] 16s rna 如何对otu表进行拉平处理

各位好,请问一下 ,就是我们在做alpha多样性之前,需要对otu表根据最低测序深度进行随机重抽样,即拉平处理,我知道qiime中的parallel_multiple_rarefactions.py可以实现otu矩阵稀疏化,并会输出好几个稀疏化的文件,公司说可以通过R软件对多次稀疏化结果取均值,得到最终的拉平后的otu矩阵。请问这里的取均值是什么意思,就是多个表格中重复出现的么?
    下面是其中一个稀疏化后得到的otu表,假如有10个这种表的化应如何取均值?希望各位能贴一下脚本16s rna  如何对otu表进行拉平处理
Y6YLS3MABA1X$HOO(80B19O.png
回复此楼

» 本帖附件资源列表

  • 欢迎监督和反馈:小木虫仅提供交流平台,不对该内容负责。
    本内容由用户自主发布,如果其内容涉及到知识产权问题,其责任在于用户本人,如对版权有异议,请联系邮箱:xiaomuchong@tal.com
  • 附件 1 : rarefaction_5640_0.txt
  • 2017-06-05 21:12:22, 3.29 M

» 猜你喜欢

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
2楼2017-08-18 09:24:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
3楼2017-08-18 17:09:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
4楼2017-08-19 17:04:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
5楼2017-08-20 09:26:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
6楼2017-08-21 00:58:59
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 相见很不晚 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 考研调剂 +7 呼呼?~+123456 2026-03-24 7/350 2026-03-26 15:24 by 小小麦片
[硕博家园] 北京林业大学硕导招生广告 +5 kongweilin 2026-03-26 7/350 2026-03-26 14:37 by mapenggao
[考研] 材料与化工304求B区调剂 +3 邱gl 2026-03-26 5/250 2026-03-26 13:33 by 邱gl
[考研] 一志愿南航 335分 | 0856材料化工 | GPA 4.07 | 有科研经历 +6 cccchenso 2026-03-23 6/300 2026-03-25 22:25 by 544594351
[考研] 26考研-291分-厦门大学(085601)-柔性电子学院材料工程专业求调剂 +3 min3 2026-03-24 4/200 2026-03-25 18:22 by xcjcqu
[考研] 招08考数学 +8 laoshidan 2026-03-20 17/850 2026-03-25 17:52 by 一个红太阳
[考研] 材料学硕333求调剂 +4 北道巷 2026-03-24 4/200 2026-03-25 14:16 by mapenggao
[考研] 284求调剂 +15 Zhao anqi 2026-03-22 15/750 2026-03-25 12:51 by wht0531
[考研] 0854电子信息求调剂 324 +4 Promise-jyl 2026-03-23 4/200 2026-03-25 11:36 by Sugarlight
[考研] 085600材料与化工调剂 +9 A-哆啦Z梦 2026-03-23 15/750 2026-03-25 11:18 by Ainin_
[考研] 340求调剂 +5 话梅糖111 2026-03-24 5/250 2026-03-25 06:53 by ilovexiaobin
[考研] 一志愿武理085500机械专业总分300求调剂 +3 an10101 2026-03-24 7/350 2026-03-25 00:00 by 山鬼0-
[考研] 0856材料专硕353求调剂 +6 NIFFFfff 2026-03-20 6/300 2026-03-24 21:02 by hello七七
[考研] 化工专硕求调剂 +3 question挽风 2026-03-24 3/150 2026-03-24 18:48 by jhhcooi
[考研] 求调剂 +5 林之夕 2026-03-24 5/250 2026-03-24 17:16 by dick_runner
[考研] 求调剂 +6 研研,接电话 2026-03-24 7/350 2026-03-24 17:01 by barlinike
[考研] 求调剂 +7 十三加油 2026-03-21 7/350 2026-03-23 23:48 by 热情沙漠
[考研] 一志愿070300浙大化学358分,求调剂! +4 酥酥鱼.. 2026-03-21 4/200 2026-03-23 08:12 by Iveryant
[考研] 311求调剂 +3 26研0 2026-03-20 3/150 2026-03-22 14:46 by ColorlessPI
[考研] 265求调剂 +12 梁梁校校 2026-03-19 14/700 2026-03-21 13:38 by lature00
信息提示
请填处理意见