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16s rna 如何对otu表进行拉平处理
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各位好，请问一下 ，就是我们在做alpha多样性之前，需要对otu表根据最低测序深度进行随机重抽样，即拉平处理，我知道qiime中的parallel_multiple_rarefactions.py可以实现otu矩阵稀疏化，并会输出好几个稀疏化的文件，公司说可以通过R软件对多次稀疏化结果取均值，得到最终的拉平后的otu矩阵。请问这里的取均值是什么意思，就是多个表格中重复出现的么？ 下面是其中一个稀疏化后得到的otu表，假如有10个这种表的化应如何取均值？希望各位能贴一下脚本  Y6YLS3MABA1X$HOO(80B19O.png |
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2017-06-05 21:12:22, 3.29 M
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