24小时热门版块排行榜    

北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
查看: 1728  |  回复: 5
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

微笑爱上我

新虫 (初入文坛)

[求助] NAMD动力学 已有1人参与

小伙伴们,有人知道为什么在跑由蛋白质和石墨烯构成的体系的NAMD动力学时,石墨烯会变形?谢谢啦
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xiaoniupahu

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by xiaoniupahu at 2017-05-24 19:51:25
有没有用gridforce,如果用了gridforce的话,那就是去掉石墨烯上的标记,只标记DNA就好了

对pdb文件中的beta值和occupancy值进行修改就可以了,可以写个脚本

发自小木虫Android客户端
4楼2017-05-24 19:53:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 6 个回答

jiaoyixiong

荣誉版主 (职业作家)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
你在nand里面给石墨烯设置位置限制啊。
再说,石墨烯在动力学平衡过程中本来就会变形啊,他们又不是刚体

发自小木虫Android客户端
2楼2017-05-18 00:26:36
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xiaoniupahu

新虫 (初入文坛)

有没有用gridforce,如果用了gridforce的话,那就是去掉石墨烯上的标记,只标记DNA就好了

发自小木虫Android客户端
3楼2017-05-24 19:51:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

微笑爱上我

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by jiaoyixiong at 2017-05-18 00:26:36
你在nand里面给石墨烯设置位置限制啊。
再说,石墨烯在动力学平衡过程中本来就会变形啊,他们又不是刚体

多谢,需要在参数文件里面设置吗?能请教一下怎么设置吗
5楼2017-06-05 16:51:18
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 328求调剂 +3 ghhh88888 2026-04-06 3/150 2026-04-06 21:35 by 啵啵啵0119
[考研] 一志愿哈工大,初试329,求环境科学与工程调剂! +6 余未辛 2026-04-06 6/300 2026-04-06 20:51 by lbsjt
[考研] 305求调剂 +3 77Qi 2026-04-06 3/150 2026-04-06 15:36 by going home
[考研] 081700化学工程与技术 一志愿中海洋 323 求调剂学校 +18 披星河 2026-04-03 18/900 2026-04-06 13:55 by BruceLiu320
[考研] 一志愿南京航空航天大学 材料与化工329分求调剂 +8 Mr. Z 2026-04-05 8/400 2026-04-06 09:24 by dongzh2009
[考研] 一志愿C9的化学工程(085602) 340分,感觉校内调剂无望,求调剂 +12 万事宜臻 2026-04-04 12/600 2026-04-06 07:46 by 无际的草原
[考研] 315求调剂 +14 欣喜777 2026-04-04 15/750 2026-04-06 06:25 by houyaoxu
[考研] 一志愿北交大材料工程总分358求调剂 +6 cs0106 2026-04-05 6/300 2026-04-05 16:34 by imissbao
[考研] 求生物学学硕调剂——364分 +7 云朵遛弯指南 2026-04-04 7/350 2026-04-04 22:49 by zhyzzh
[考研] 323求调剂 +8 李佳乐1 2026-04-04 8/400 2026-04-04 22:26 by hemengdong
[考研] 求调剂 +3 ffyyu 2026-04-02 3/150 2026-04-04 19:03 by 蓝云思雨
[考研] 一志愿北京科技大学材料工程085601,求调剂 +17 cdyw 2026-04-02 18/900 2026-04-04 11:14 by w_xuqing
[考研] 294求调剂 +6 Grey_Ey 2026-04-03 6/300 2026-04-03 20:46 by 欣喜777
[考研] 复试调剂 +3 bvzz 2026-04-01 3/150 2026-04-03 09:47 by 蓝云思雨
[考研] 314求调剂 +11 1xiaojun23 2026-03-31 12/600 2026-04-02 12:31 by 1xiaojun23
[考研] 0856初试324分求调剂 +6 想上学求调 2026-04-01 6/300 2026-04-02 11:42 by 星空星月
[考研] 324求调剂 +5 想上学求调 2026-04-01 6/300 2026-04-02 10:16 by sanrepian
[考研] 一志愿346上海大学生物学 +3 上海大学346调剂 2026-04-01 3/150 2026-04-02 08:36 by w虫虫123
[考研] 085602化学工程268分蹲调剂 +8 月照花林。 2026-04-01 8/400 2026-04-01 22:08 by 无际的草原
[考研] 267求调剂 +13 uiybh 2026-03-31 13/650 2026-04-01 10:25 by 探123
信息提示
请填处理意见