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请教Gaussian09 Linda版的安装和使用已有3人参与
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想学学高斯计算，网上下了几个版本的g09。搞不定跨节点并行运行，请懂的linda安装和使用的指导一下，谢谢了！ 我是这样安装的 1、实验室里面有6台i5台式机闲置，我把它们都安装了CentOS7, 主机名字分别是linux01~06，IP地址是192.168.1.11~16；设置了相同的用户名为gao，密码也相同。然后弄好了SSH，几台电脑能自由相互登录到gao用户下，无需密码。 2、在、把g09解压到/home/gao/g09文件夹下，按照网上的《g09使用手册》设置，先修改了bsd/g09.profile文件，加入主文件夹，然后修改了g09下的.bash.profile文件，添加source ...... g09.profile设置环境变量。 3. 添加Default.Route文件到g09文件夹中，内容如下： -M- 6GB -P- 24 -#- MaxDisk=80GB -W- linux01:4,linux02:4,linux03:4,linux04:4,linux05:4,linux06:4 -S- linux01 4. 在gao文件夹下增加了.tsnet.config文件，里面增加了Tsnet.Node.lindarsharg: ssh, 和相应的主机名 所有的电脑设置基本一样。都在相同位置安装了g09 5. 弄一个的输入文件试算了一下，文件头是这样的。 %chk=/tmp/test01/test03.chk %NProcShared=4 %LindaWorkers=linux01:2,linux02:2 # opt hf/6-31(d) test03 0 1 C -2.14340000 1.65000000 0.00000000 C -2.14340000 0.82500000 0.00000000 C -1.42890000 0.41250000 0.00000000 C -0.71450000 0.82500000 0.00000000 ..... 现在的问题是，单机能算，4个核都满的，但是其他电脑没有反应，没有l502在运行，核也是空闲的。 我该怎么办啊？ G09不是编译了linda了么？不需要另外安装linda吧？或者需要安装PBS软件才行？ 请各位大侠不宁赐教！ |
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qchem
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2楼2017-05-13 07:31:17
送红花一朵|
谢谢回复！ 怎么才能知道软件包中含不含Linda呢？下过4个版本，看文件夹结构都一样，但其中一个最大，解压后达到2.3G，其他在1.6G左右。 有人说还需要安装并行调度软件，是这样么？ 发自小木虫Android客户端 |
3楼2017-05-13 07:55:27
qchem
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4楼2017-05-13 11:59:38
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谢谢你的回复！ 我在文件夹中只找到”.exe“文件，没有“.exel”文件，我把g09文件夹下的所有文件和bsd下的所有文件都列出来，麻烦你帮我看看。 g09文件夹下的文件： 2017/05/11 周四 15:33 <DIR> . 2017/05/11 周四 15:33 <DIR> .. 2013/01/10 周四 06:06 15,566 amber.prm 2013/01/10 周四 06:06 31,388 amber98.prm 2017/05/11 周四 15:33 <DIR> basis 2017/05/11 周四 15:33 <DIR> bsd 2013/05/01 周三 13:04 687,600 c8609 2013/05/01 周三 13:04 225 c8609.hlp 2013/05/01 周三 13:04 889,504 chkchk 2013/04/26 周五 00:29 809,721 copychk 2013/05/01 周三 13:04 24,676,016 cubegen 2013/05/01 周三 13:04 2,486 cubegen.hlp 2013/05/01 周三 13:04 462,720 cubman 2013/05/01 周三 13:04 1,478 cubman.hlp 2013/05/01 周三 13:04 407,160 demofc 2013/01/10 周四 06:06 169,617 dftba.prm 2013/01/10 周四 06:06 953 dftbpar.prm 2017/05/11 周四 15:33 <DIR> doc 2013/01/10 周四 06:06 5,521 dreiding.prm 2013/04/26 周五 00:04 0 em64t.flag 2013/05/01 周三 13:04 818,656 formchk 2013/05/01 周三 13:04 953 formchk.hlp 2013/05/01 周三 13:04 26,873,840 freqchk 2013/05/01 周三 13:04 401,328 freqmem 2013/05/01 周三 13:04 439,576 g09 2013/05/01 周三 13:04 32,160 gau-cpp 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5楼2017-05-15 09:09:53
蓝天飞翔
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6楼2017-05-15 10:00:13
zhangmt
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“我该怎么办啊？ G09不是编译了linda了么？不需要另外安装linda吧？或者需要安装PBS软件才行？ 请各位大侠不宁赐教！” 你说对了，linda是需要另行安装的（可以单买Gaussian不带linda，要买linda需要多加钱的），一般在gaussian目录下，对，就是你列出来的bsd, basis, doc, tests等等目录之外，还应该有一个linda的目录（看不同版本的Gaussian，可能是linda7.1或者linda8.2之类的），没有linda只能单机多核并行，不能多机并行。 |
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7楼2017-05-15 11:35:47
yicong2010
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安装PBS来控制linda，高斯下夸节点运行不好，弄八核的单机跑，多任务总效率比并行的单任务高。 发自小木虫IOS客户端 |
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8楼2017-05-15 12:16:28
9楼2017-05-15 14:33:13
10楼2017-05-15 14:35:46