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tanya

木虫 (正式写手)

[求助] 请教Gaussian09 Linda版的安装和使用已有3人参与

想学学高斯计算,网上下了几个版本的g09。搞不定跨节点并行运行,请懂的linda安装和使用的指导一下,谢谢了!
我是这样安装的
1、实验室里面有6台i5台式机闲置,我把它们都安装了CentOS7, 主机名字分别是linux01~06,IP地址是192.168.1.11~16;设置了相同的用户名为gao,密码也相同。然后弄好了SSH,几台电脑能自由相互登录到gao用户下,无需密码。
2、在、把g09解压到/home/gao/g09文件夹下,按照网上的《g09使用手册》设置,先修改了bsd/g09.profile文件,加入主文件夹,然后修改了g09下的.bash.profile文件,添加source ...... g09.profile设置环境变量。
3. 添加Default.Route文件到g09文件夹中,内容如下:
-M- 6GB
-P- 24
-#- MaxDisk=80GB
-W- linux01:4,linux02:4,linux03:4,linux04:4,linux05:4,linux06:4
-S- linux01
4. 在gao文件夹下增加了.tsnet.config文件,里面增加了Tsnet.Node.lindarsharg: ssh, 和相应的主机名
所有的电脑设置基本一样。都在相同位置安装了g09
5. 弄一个的输入文件试算了一下,文件头是这样的。

%chk=/tmp/test01/test03.chk
%NProcShared=4
%LindaWorkers=linux01:2,linux02:2
# opt hf/6-31(d)

test03

0 1
C                 -2.14340000    1.65000000    0.00000000
C                 -2.14340000    0.82500000    0.00000000
C                 -1.42890000    0.41250000    0.00000000
C                 -0.71450000    0.82500000    0.00000000
.....

现在的问题是,单机能算,4个核都满的,但是其他电脑没有反应,没有l502在运行,核也是空闲的。
我该怎么办啊?
G09不是编译了linda了么?不需要另外安装linda吧?或者需要安装PBS软件才行?
请各位大侠不宁赐教!
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tanya

木虫 (正式写手)

送红花一朵
引用回帖:
7楼: Originally posted by zhangmt at 2017-05-15 11:35:47
“我该怎么办啊?
G09不是编译了linda了么?不需要另外安装linda吧?或者需要安装PBS软件才行?
请各位大侠不宁赐教!”

你说对了,linda是需要另行安装的(可以单买Gaussian不带linda,要买linda需要多加钱的 ...

谢谢回复!
在网上看来看去,只看到G03的linda详细安装过程,是要单独安装Linda的,G09的没看到,我还以为不用单独安装了。看来只能单机算算了。
10楼2017-05-15 14:35:46
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qchem

铁杆木虫 (著名写手)


【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
你得先有Linda版的Gaussian才行,网上下的应该都没Linda

发自小木虫IOS客户端

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

2楼2017-05-13 07:31:17
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tanya

木虫 (正式写手)

送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by qchem at 2017-05-13 07:31:17
你得先有Linda版的Gaussian才行,网上下的应该都没Linda

谢谢回复!
怎么才能知道软件包中含不含Linda呢?下过4个版本,看文件夹结构都一样,但其中一个最大,解压后达到2.3G,其他在1.6G左右。
有人说还需要安装并行调度软件,是这样么?

发自小木虫Android客户端
3楼2017-05-13 07:55:27
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qchem

铁杆木虫 (著名写手)


【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by tanya at 2017-05-13 07:55:27
谢谢回复!
怎么才能知道软件包中含不含Linda呢?下过4个版本,看文件夹结构都一样,但其中一个最大,解压后达到2.3G,其他在1.6G左右。
有人说还需要安装并行调度软件,是这样么?
...

那些link文件有后缀是.exel的

发自小木虫IOS客户端
4楼2017-05-13 11:59:38
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