| 查看: 4285 | 回复: 11 | ||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | ||
[求助]
请教Gaussian09 Linda版的安装和使用已有3人参与
|
||
|
想学学高斯计算，网上下了几个版本的g09。搞不定跨节点并行运行，请懂的linda安装和使用的指导一下，谢谢了！ 我是这样安装的 1、实验室里面有6台i5台式机闲置，我把它们都安装了CentOS7, 主机名字分别是linux01~06，IP地址是192.168.1.11~16；设置了相同的用户名为gao，密码也相同。然后弄好了SSH，几台电脑能自由相互登录到gao用户下，无需密码。 2、在、把g09解压到/home/gao/g09文件夹下，按照网上的《g09使用手册》设置，先修改了bsd/g09.profile文件，加入主文件夹，然后修改了g09下的.bash.profile文件，添加source ...... g09.profile设置环境变量。 3. 添加Default.Route文件到g09文件夹中，内容如下： -M- 6GB -P- 24 -#- MaxDisk=80GB -W- linux01:4,linux02:4,linux03:4,linux04:4,linux05:4,linux06:4 -S- linux01 4. 在gao文件夹下增加了.tsnet.config文件，里面增加了Tsnet.Node.lindarsharg: ssh, 和相应的主机名 所有的电脑设置基本一样。都在相同位置安装了g09 5. 弄一个的输入文件试算了一下，文件头是这样的。 %chk=/tmp/test01/test03.chk %NProcShared=4 %LindaWorkers=linux01:2,linux02:2 # opt hf/6-31(d) test03 0 1 C -2.14340000 1.65000000 0.00000000 C -2.14340000 0.82500000 0.00000000 C -1.42890000 0.41250000 0.00000000 C -0.71450000 0.82500000 0.00000000 ..... 现在的问题是，单机能算，4个核都满的，但是其他电脑没有反应，没有l502在运行，核也是空闲的。 我该怎么办啊？ G09不是编译了linda了么？不需要另外安装linda吧？或者需要安装PBS软件才行？ 请各位大侠不宁赐教！ |
回复此楼» 猜你喜欢
有偿调查问卷，一元一份，有意请私我（不要豆包）
已经有1人回复
-
求助ORCA计算单点能的输入输出文件
已经有0人回复
-
物理化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有178人回复
-
中教金源的流动池
已经有0人回复
-
RSC ADV状态问题
已经有4人回复
-
湖南大学招收锂离子电池、离子液体、高分子与凝胶材料、电催化方向博士生多名
已经有7人回复
-
南京大学蔡亮课题组诚招2026年申请-考核制博士生2-3名（电解水制氢，XAFS谱学等）
已经有32人回复
-
求助各位大佬配位化学学习教材！！！
已经有0人回复
-
大连海事大学国家级人才团队2026年博士研究生招生启事
已经有10人回复
-
内蒙古大学青年长江学者王蕾教授课题组2026年博士招聘，2-3人
已经有11人回复
-
多相催化-2026年CSC博士及洪堡合作博士后招生！
已经有0人回复
zhangmt
至尊木虫 (著名写手)
我叫MT
- QC强帖: 5
- 应助: 99 (初中生)
- 金币: 6961.8
- 散金: 10406
- 红花: 49
- 帖子: 1761
- 在线: 763.2小时
- 虫号: 880392
- 注册: 2009-10-22
- 性别: GG
- 专业: 理论和计算化学
【答案】应助回帖
感谢参与，应助指数 +1
|
“我该怎么办啊？ G09不是编译了linda了么？不需要另外安装linda吧？或者需要安装PBS软件才行？ 请各位大侠不宁赐教！” 你说对了，linda是需要另行安装的（可以单买Gaussian不带linda，要买linda需要多加钱的），一般在gaussian目录下，对，就是你列出来的bsd, basis, doc, tests等等目录之外，还应该有一个linda的目录（看不同版本的Gaussian，可能是linda7.1或者linda8.2之类的），没有linda只能单机多核并行，不能多机并行。 |
7楼2017-05-15 11:35:47
qchem
铁杆木虫 (著名写手)
- 应助: 280 (大学生)
- 金币: 6871.6
- 散金: 1411
- 红花: 43
- 帖子: 2586
- 在线: 668.9小时
- 虫号: 183011
- 注册: 2006-02-12
- 专业: 理论和计算化学
2楼2017-05-13 07:31:17
送红花一朵|
谢谢回复！ 怎么才能知道软件包中含不含Linda呢？下过4个版本，看文件夹结构都一样，但其中一个最大，解压后达到2.3G，其他在1.6G左右。 有人说还需要安装并行调度软件，是这样么？ 发自小木虫Android客户端 |
3楼2017-05-13 07:55:27
qchem
铁杆木虫 (著名写手)
- 应助: 280 (大学生)
- 金币: 6871.6
- 散金: 1411
- 红花: 43
- 帖子: 2586
- 在线: 668.9小时
- 虫号: 183011
- 注册: 2006-02-12
- 专业: 理论和计算化学
4楼2017-05-13 11:59:38