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请教Gaussian09 Linda版的安装和使用已有3人参与
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想学学高斯计算,网上下了几个版本的g09。搞不定跨节点并行运行,请懂的linda安装和使用的指导一下,谢谢了! 我是这样安装的 1、实验室里面有6台i5台式机闲置,我把它们都安装了CentOS7, 主机名字分别是linux01~06,IP地址是192.168.1.11~16;设置了相同的用户名为gao,密码也相同。然后弄好了SSH,几台电脑能自由相互登录到gao用户下,无需密码。 2、在、把g09解压到/home/gao/g09文件夹下,按照网上的《g09使用手册》设置,先修改了bsd/g09.profile文件,加入主文件夹,然后修改了g09下的.bash.profile文件,添加source ...... g09.profile设置环境变量。 3. 添加Default.Route文件到g09文件夹中,内容如下: -M- 6GB -P- 24 -#- MaxDisk=80GB -W- linux01:4,linux02:4,linux03:4,linux04:4,linux05:4,linux06:4 -S- linux01 4. 在gao文件夹下增加了.tsnet.config文件,里面增加了Tsnet.Node.lindarsharg: ssh, 和相应的主机名 所有的电脑设置基本一样。都在相同位置安装了g09 5. 弄一个的输入文件试算了一下,文件头是这样的。 %chk=/tmp/test01/test03.chk %NProcShared=4 %LindaWorkers=linux01:2,linux02:2 # opt hf/6-31(d) test03 0 1 C -2.14340000 1.65000000 0.00000000 C -2.14340000 0.82500000 0.00000000 C -1.42890000 0.41250000 0.00000000 C -0.71450000 0.82500000 0.00000000 ..... 现在的问题是,单机能算,4个核都满的,但是其他电脑没有反应,没有l502在运行,核也是空闲的。 我该怎么办啊? G09不是编译了linda了么?不需要另外安装linda吧?或者需要安装PBS软件才行? 请各位大侠不宁赐教! |
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yicong2010
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8楼2017-05-15 12:16:28
qchem
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2楼2017-05-13 07:31:17
送红花一朵|
谢谢回复! 怎么才能知道软件包中含不含Linda呢?下过4个版本,看文件夹结构都一样,但其中一个最大,解压后达到2.3G,其他在1.6G左右。 有人说还需要安装并行调度软件,是这样么? 发自小木虫Android客户端 |
3楼2017-05-13 07:55:27
qchem
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4楼2017-05-13 11:59:38














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