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w2016yw

新虫 (小有名气)

[求助] issr PCR引物筛选

我想问下 Issr的引物是一个体系就用一条吗?还是像一般PCR一样必须用一对? 具体怎么进行引物筛选呢?是不是跑PCR然后跑胶看出条带的状态呢?可是体系和PCR程序定不下来引物也定不下来不是就没法进行了啊?

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wbhnan

新虫 (初入文坛)


西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2017-05-10 07:54:25
ISSR(inter simple sequence repeat)顾名思义就是简单序列重复间区的DNA序列,该标记技术是由Zietkiewicz et al. (1994)提出的,检测的是基因组中两个SSR之间的一段短的DNA序列上的多态性。利用植物基因组中广泛存在的SSR序列,设计各种能够与SSR序列结合的PCR引物,对两个相距较近、方向相反的SSR序列之间的区段扩增。ISSR所用的PCR引物长度在20bps左右,因此可以采用与常规PCR相同的条件,其稳定性比PAPD好。ISSR标记呈典型的孟德尔式遗传,一般表现为显性或共显性。近年来ISSR标记已经广泛应用于植物遗传与育种的各个研究领域。研究表明,基于双核甘酸重复序列基元(AC)n的序列非常适合于小麦的染色体作图(Kojima et al. ,1998);而基于(AG)n和(CT)n序列的ISSR在柏树和松树中极具应用价值(Tsumura et al. ,1996)。

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2楼2017-05-10 07:29:08
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wbhnan

新虫 (初入文坛)

不是说非用一对,但是你得筛选合适的引物

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3楼2017-05-10 13:35:29
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w2016yw

新虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by wbhnan at 2017-05-10 13:35:29
不是说非用一对,但是你得筛选合适的引物

问题是不会,求具体

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4楼2017-05-10 14:11:28
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wbhnan

新虫 (初入文坛)

★ ★
西门吹雪170: 金币+2, 鼓励回帖交流 2017-05-11 07:48:00
普通的PCR体系都是加进去上下游一对引物的,最终得到的将是两个引物之间的特异序列,而单引物扩增就是只在PCR体系中加入一种引物进行得所谓的“扩增”,这种PCR的目的并不是为了扩增特异序列,它最终电泳的结果就是一个smear,它主要用于DNA序列测序上.白话点就是说在这段序列中你选的引物要在你要的目的序列前后都有结合位点

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5楼2017-05-10 14:53:18
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w2016yw

新虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by wbhnan at 2017-05-10 14:53:18
普通的PCR体系都是加进去上下游一对引物的,最终得到的将是两个引物之间的特异序列,而单引物扩增就是只在PCR体系中加入一种引物进行得所谓的“扩增”,这种PCR的目的并不是为了扩增特异序列,它最终电泳的结果就是一个 ...

谢谢~

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6楼2017-05-10 21:51:16
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哈呆帅皮

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by w2016yw at 2017-05-10 14:11:28
问题是不会,求具体
...

那筛选的时候是一个引物加到各个品种里面之后。再用另外一个引物再各自加进去吗,就像排列组合那样做很多个pcr试管吗
7楼2018-08-01 12:14:16
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