24小时热门版块排行榜    

查看: 1292  |  回复: 7
【悬赏金币】回答本帖问题,作者许你安然然将赠送您 5 个金币
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

许你安然然

新虫 (初入文坛)

[求助] 复合物中的配体是短肽,怎么删除配体,仅保留受体蛋白呢?已有1人参与

如题,新手,刚刚接触分子模拟,看过其他帖子配体都是小分子,如果配体也是蛋白应该怎么删除呢?

发自小木虫Android客户端
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

许你安然然

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
7楼: Originally posted by hclwonder at 2017-03-24 22:42:43
pymol在display菜单可以选择显示sequence,在sequence选中不想要的peptide,右键remove删除;如果要去掉水(假如有的话),右侧点“A”-“remove waters”即可。
然后file-save molecule,完成。
...

我就是这么做的,谢谢^ω^

发自小木虫Android客户端
8楼2017-03-25 11:26:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 8 个回答

mddock

新虫 (小有名气)

2楼2017-03-23 20:52:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hclwonder

新虫 (正式写手)

一般会是两条链chain,选中多肽那条删去再保存即可。找个合适的分子显示软件比如ds的client或者schrodinger的maestro或者其它软件。

发自小木虫Android客户端
3楼2017-03-23 21:54:59
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

许你安然然

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by hclwonder at 2017-03-23 21:54:59
一般会是两条链chain,选中多肽那条删去再保存即可。找个合适的分子显示软件比如ds的client或者schrodinger的maestro或者其它软件。

请问我用pymol选中了后面的一段蛋白,然后删掉了,这样可以吗?原pdb是x-ray得到的,是不是没有水啊?

发自小木虫Android客户端
4楼2017-03-24 19:15:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
不应助 确定回帖应助 (注意:应助才可能被奖励,但不允许灌水,必须填写15个字符以上)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[论文投稿] 编辑是什么意思 15+3 s090604054 2024-06-15 3/150 2024-06-16 10:29 by bobvan
[教师之家] 每次骚扰女学生的都是院系领导,而不是普通教师,小编们要注意措辞正确 +8 zju2000 2024-06-15 10/500 2024-06-16 09:22 by Quakerbird
[考博] 34岁读博士晚吗 +26 emitdne 2024-06-13 26/1300 2024-06-16 07:16 by liyeqik
[基金申请] 面青地会评时间 +5 tanjydd 2024-06-15 5/250 2024-06-15 23:08 by andywei1028
[基金申请] Nature 11日发文,中国著名学者们称造假迫不得已 +5 babu2015 2024-06-14 5/250 2024-06-15 20:40 by lc231001
[硕博家园] 博士毕业高校和就业的相关问题 +4 SCITOPPP 2024-06-14 6/300 2024-06-15 18:54 by SCITOPPP
[基金申请] 为什么我的博后基金还在流动站审核中?不会是学院给我卡了吧? +14 王凯12 2024-06-13 26/1300 2024-06-15 15:22 by 好人与坏人
[基金申请] 有没有机械的前辈分享一下评上海优都是什么成果啊 +7 wulala800 2024-06-10 7/350 2024-06-15 09:33 by 晓目崇
[论文投稿] 投了一篇4区的SCI,审稿人一个拒稿,一个小修,编辑给了大修。 +9 安稳22123 2024-06-13 10/500 2024-06-14 23:45 by jurkat.1640
[食品] 食品博士导师 +6 小李醒yy 2024-06-11 9/450 2024-06-14 23:37 by 小李醒yy
[基金申请] 面上基金有一个(两个)C是不是就没戏了.... 5+3 zzzm116 2024-06-13 17/850 2024-06-14 22:26 by lzt8076
[基金申请] 博士后基金需要结题吗? +8 zhouchuck 2024-06-13 8/400 2024-06-14 17:27 by liuyupu132
[基金申请] E12面上申请 +4 汉风之遗 2024-06-13 4/200 2024-06-14 15:28 by 天外飞去来
[硕博家园] 关于硕博连读的一些疑问? +4 Lwenter 2024-06-14 4/200 2024-06-14 14:32 by ou0551
[有机交流] 旋蒸请教 +6 办公室摸鱼 2024-06-09 9/450 2024-06-13 21:31 by wuxiaominggo
[基金申请] 连续两年医学口青年项目初审体会 +11 进击的荣耀 2024-06-09 18/900 2024-06-13 17:27 by 进击的荣耀
[硕博家园] 机械研究生如何拿到年薪40+w +13 阿巴阿巴哦哦 2024-06-11 15/750 2024-06-13 15:40 by 113745685
[有机交流] 原料反应完了,怎么知道是产物还是中间体 +6 小胡在努力 2024-06-11 8/400 2024-06-13 13:33 by 091602
[论文投稿] 摩擦磨损论文投稿 +3 jmysan 2024-06-12 3/150 2024-06-13 08:36 by 莱茵润色
[硕博家园] 申博 +3 悦悦小小鱼 2024-06-12 3/150 2024-06-12 15:11 by chen5805
信息提示
请填处理意见