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笨笨的云

铜虫 (初入文坛)

[求助] 加酶切位点后扩增不出来了,在线求助

原来扩的很容易,加了酶切位点和保护碱基后就再也扩不出来了,各种方法都试过了,退火温度,体系改变,做touchdown也试过,就是扩不出来,快急死了,求助各位给点ideal!
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活到老学到老
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匿名

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8楼2017-03-08 09:35:22
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原海亮

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

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你的模板是什么呢,基因组还是质粒?加了酶切位点后,是什么都扩增不出来,还是扩增出来但特异性不好?实在不行用比较笨的方法,你可以用不加酶切位点的引物扩增,然后连接T载体,然后提质粒,再用加酶切位点的引物来扩增。

发自小木虫Android客户端
天空才是极限,我有信心飞的更高!
9楼2017-03-08 19:13:51
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781055707

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

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,你把你PCR的产物,用加了酶切位点的引物扩呗。
采菊东篱下,悠然见南山。
4楼2017-03-07 16:53:43
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笨笨的云

铜虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 781055707 at 2017-03-07 16:53:43
,你把你PCR的产物,用加了酶切位点的引物扩呗。

可以吗?师兄说PCR产物不能做模板,里面成分太多了,会影响扩增。我问过其他师兄,凡是做过的都没做出来。
活到老学到老
5楼2017-03-07 20:35:58
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绝对零度的笑

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


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西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2017-03-08 07:40:33
你把PCR产物1:10稀释一下再取1ul做模板,50ul体系再P一次。PCR产物里面因为有大量剩余引物,会影响新的引物退火,你多稀释一下把旧的引物浓度降下来,应该就可以扩增了。
6楼2017-03-08 00:24:02
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781055707

木虫 (著名写手)

引用回帖:
5楼: Originally posted by 笨笨的云 at 2017-03-07 20:35:58
可以吗?师兄说PCR产物不能做模板,里面成分太多了,会影响扩增。我问过其他师兄,凡是做过的都没做出来。...

可以的,不过你要把PCR产物纯化下,或跑个30个循环,取个0.1,0.2,0.3,0.4,0.5UL做模板,我做巢式PCR和重叠PCR用的都是PCR产物。做科研没有绝对的不能用,主要看方法和大胆的尝试。
采菊东篱下,悠然见南山。
7楼2017-03-08 07:52:44
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普通回帖

匿名

用户注销 (著名写手)


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西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2017-03-08 07:40:15
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2楼2017-03-07 15:04:24
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笨笨的云

铜虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by pf790352975 at 2017-03-07 15:04:24
确定所有东西和未加酶切位点和保护碱基的一样吗?
如果一样 那估计还要摸索下退火温度  适当降低

模板是一样的,加酶切位点后Tm值变高了,我从高到低摸索了很大的梯度,还是不行。
活到老学到老
3楼2017-03-07 15:22:26
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笨笨的云

铜虫 (初入文坛)

引用回帖:
9楼: Originally posted by 原海亮 at 2017-03-08 19:13:51
你的模板是什么呢,基因组还是质粒?加了酶切位点后,是什么都扩增不出来,还是扩增出来但特异性不好?实在不行用比较笨的方法,你可以用不加酶切位点的引物扩增,然后连接T载体,然后提质粒,再用加酶切位点的引物 ...

谢谢,实在不行就只能做T克隆了
活到老学到老
10楼2017-03-09 08:59:32
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