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NGS 捕获
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1 作为一家NGS领域的技术型公司,有着某种国内相对领先的技术优势,但在复制能力极强的中国大陆,该如何发展有自身特色的精准医学?如何选取优势机构和方向进行延伸,并有效与国家资助的机构或企业进行良性竞争? 2 关于NGS领域的捕获,有几种方法?都有什么特点,适用于什么领域?国内外主要的产有什么? 3 实际项目案例,某客户有100例样本的神经肌肉病样本,客户之前用一个100gene的panel进行过筛查,均为阴性,但是临床有明确遗传倾向性的,客户认为这批样本一定可以找到一些新的突变,该项目该如何设计? 4 实际产品开发案例1-前端,目前需要开发一个泛癌种捕获panel,该产品一旦设计成功,是可以作为标准产品,在各大公司及高校进行销售的,作为产品负责人,该如何有效的获得基因列表,并进行后续推进? 提示:要考虑到产品出处、产品亮点、国内外竞品的现状 5 实际产品开发案例2-后端,目前需要开发一个关于ctDNA的多重PCRpanel,都会有什么难点需要和研发部进行讨论,该如何分步骤进行逐步开发? 6 实际产品性价比测试:某Panel有150个gene,目标区域大小520K,200X有效测序深度、实测数据捕获效率50%、dup5%、QC95%、比对率98% 该产品的预计raw data数量量为多少? 有哪位大神能给点意见的?尤其最后一个问题完全不懂啊 谢谢谢谢啦 |
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西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2017-02-19 08:34:54
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只说最后一道。设raw reads 为x。X*95%*98%=520K*200*50%*(1+5%)这个算出raw data序列总有多少bp。其实不是raw data fastqc的文件大小。不过出题也不明确 发自小木虫IOS客户端 |

2楼2017-02-19 07:59:50
像鱼一样飞吧
新虫 (初入文坛)
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3楼2020-05-11 10:36:19










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