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[求助]
NGS 捕获
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1 作为一家NGS领域的技术型公司，有着某种国内相对领先的技术优势，但在复制能力极强的中国大陆，该如何发展有自身特色的精准医学？如何选取优势机构和方向进行延伸，并有效与国家资助的机构或企业进行良性竞争？ 2 关于NGS领域的捕获，有几种方法？都有什么特点，适用于什么领域？国内外主要的产有什么？ 3 实际项目案例，某客户有100例样本的神经肌肉病样本，客户之前用一个100gene的panel进行过筛查，均为阴性，但是临床有明确遗传倾向性的，客户认为这批样本一定可以找到一些新的突变，该项目该如何设计？ 4 实际产品开发案例1-前端，目前需要开发一个泛癌种捕获panel，该产品一旦设计成功，是可以作为标准产品，在各大公司及高校进行销售的，作为产品负责人，该如何有效的获得基因列表，并进行后续推进？ 提示：要考虑到产品出处、产品亮点、国内外竞品的现状 5 实际产品开发案例2-后端，目前需要开发一个关于ctDNA的多重PCRpanel，都会有什么难点需要和研发部进行讨论，该如何分步骤进行逐步开发？ 6 实际产品性价比测试：某Panel有150个gene，目标区域大小520K，200X有效测序深度、实测数据捕获效率50%、dup5%、QC95%、比对率98% 该产品的预计raw data数量量为多少？ 有哪位大神能给点意见的？尤其最后一个问题完全不懂啊 谢谢谢谢啦 |
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西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2017-02-19 08:34:54
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只说最后一道。设raw reads 为x。X*95%*98%=520K*200*50%*（1+5%）这个算出raw data序列总有多少bp。其实不是raw data fastqc的文件大小。不过出题也不明确 发自小木虫IOS客户端 |
2楼2017-02-19 07:59:50
像鱼一样飞吧
新虫 (初入文坛)
- 应助: 1 (幼儿园)
- 金币: 72.5
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- 专业: 作物种质资源与遗传育种学
3楼2020-05-11 10:36:19
