24小时热门版块排行榜    

查看: 1222  |  回复: 2

秋空霁海

新虫 (初入文坛)

[求助] NGS 捕获

1 作为一家NGS领域的技术型公司,有着某种国内相对领先的技术优势,但在复制能力极强的中国大陆,该如何发展有自身特色的精准医学?如何选取优势机构和方向进行延伸,并有效与国家资助的机构或企业进行良性竞争?
2 关于NGS领域的捕获,有几种方法?都有什么特点,适用于什么领域?国内外主要的产有什么?
3 实际项目案例,某客户有100例样本的神经肌肉病样本,客户之前用一个100gene的panel进行过筛查,均为阴性,但是临床有明确遗传倾向性的,客户认为这批样本一定可以找到一些新的突变,该项目该如何设计?
4 实际产品开发案例1-前端,目前需要开发一个泛癌种捕获panel,该产品一旦设计成功,是可以作为标准产品,在各大公司及高校进行销售的,作为产品负责人,该如何有效的获得基因列表,并进行后续推进?
提示:要考虑到产品出处、产品亮点、国内外竞品的现状
5 实际产品开发案例2-后端,目前需要开发一个关于ctDNA的多重PCRpanel,都会有什么难点需要和研发部进行讨论,该如何分步骤进行逐步开发?
6 实际产品性价比测试:某Panel有150个gene,目标区域大小520K,200X有效测序深度、实测数据捕获效率50%、dup5%、QC95%、比对率98%
该产品的预计raw data数量量为多少?

有哪位大神能给点意见的?尤其最后一个问题完全不懂啊
谢谢谢谢啦
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

drwhoknowss

荣誉版主 (正式写手)


西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2017-02-19 08:34:54
只说最后一道。设raw reads 为x。X*95%*98%=520K*200*50%*(1+5%)这个算出raw data序列总有多少bp。其实不是raw data fastqc的文件大小。不过出题也不明确

发自小木虫IOS客户端
Progress in science depends on new techniques, new discoveries and new ideas, probably in that order. -- Nobel laureate Sydney Brenner
2楼2017-02-19 07:59:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

像鱼一样飞吧

新虫 (初入文坛)

感觉问题比较多,作为NGS的技术型公司是指可以进行二代测序么?后面又说是做捕获测序,做捕获测序一般两种方法:设计探针进行液相捕获测序和设计引物进行多重pcr引物扩增两种方法
3楼2020-05-11 10:36:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 秋空霁海 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[教师之家] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 BnSlaJi8z5Vo 2026-08-17 3/150 2026-08-17 17:38 by CBFiACZS7HAK
[基金申请] 感觉是下周放榜了 +4 angus9576 2026-08-17 8/400 2026-08-17 17:26 by angus9576
[基金申请] filecode=后面第一个是大写字母 +8 wangze12014 2026-08-14 10/500 2026-08-17 17:05 by xter9665
[基金申请] 欢迎发来filecode的Mz6后的代码验证其规律 +34 医学老男孩 2026-08-13 81/4050 2026-08-17 16:20 by yudaoqian88
[博后之家] 售SCI一区文章,我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +4 6GojgJvkDudM 2026-08-16 7/350 2026-08-17 16:14 by CBFiACZS7HAK
[基金申请] 时间戳变了,能看出什么问题? +4 基诺咪客 2026-08-17 4/200 2026-08-17 16:10 by Vivilian
[基金申请] 哪位老哥知道今年的国自然具体哪一天放榜? +12 Ldrop2023 2026-08-13 15/750 2026-08-17 15:02 by 小豌豆_发芽
[考研] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 EWi2p09MOOv8 2026-08-16 6/300 2026-08-17 14:02 by EYK67XJMj64E
[基金申请] 今天系统多次维护,明天很可能放榜! +8 zju2000 2026-08-16 9/450 2026-08-17 12:20 by lmz0216
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 i7NFEVbjQMM5 2026-08-16 4/200 2026-08-17 12:10 by 4GBAYCdVQoK3
[教师之家] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +3 6GojgJvkDudM 2026-08-16 3/150 2026-08-17 09:49 by xLVPIRuSvCUe
[论文投稿] 岩土工程学报什么时候才能终审完呐 25+3 yeager111 2026-08-10 4/200 2026-08-16 20:42 by tfang
[基金申请] 有时候,自然基金真的不能太认真 (我的申报经验) +10 majunge000 2026-08-11 12/600 2026-08-16 08:18 by xli1984
[精细化工] 招聘 金属平磨液,抛光液研发工程师 +3 小天0311 2026-08-14 3/150 2026-08-16 07:31 by H9PLUS
[基金申请] 各位道友,我要去昆明玩几天,回来见。 +7 Tide man 2026-08-14 8/400 2026-08-15 01:11 by arzu_hma
[基金申请] 是这周出结果还是下周出结果? +4 yuleib84 2026-08-11 4/200 2026-08-14 23:05 by lfy8008
[基金申请] 不应该看fileCode +7 且听虎啸 2026-08-12 9/450 2026-08-13 14:27 by flydreamws
[基金申请] 分享一下我之前已中青C的计划书的filecode +4 布布和一二 2026-08-11 5/250 2026-08-13 12:56 by cratir
[基金申请] 结合人工智能,周易传统文化,filecode打分制来了,3分以上希望很大。 +3 Tide man 2026-08-12 4/200 2026-08-13 08:35 by ZJTJZ
[基金申请] 什么时候出结果,有咨询渠道??? +3 Tide man 2026-08-11 3/150 2026-08-11 17:54 by kudofaye
信息提示
请填处理意见