应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » 轨迹文件形式转化问题
51/1返回列表
查看: 2161  |  回复: 5
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

MD初学者

新虫 (初入文坛)

[求助] 轨迹文件形式转化问题

想问一下Gromacs模拟生成的xtc轨迹文件如何转化为nMoldyn可以分析的.nc文件？谢谢。
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2017-02-14 15:43:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

MD初学者

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
4楼: Originally posted by 缘自阳光 at 2017-02-15 11:34:03
抱歉我没用过Gromacs,不知道具体有什么软件可用，但lammps和NAMD等轨迹文件都是比较简单的，编程处理一下应该不难。...

嗯，好的，谢谢
回复此楼
6楼2017-02-15 20:30:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 6 个回答

缘自阳光

新虫 (初入文坛)
可以试试编程读入xtc轨迹文件，然后按照要求格式写成.nc文件。
赞一下 回复此楼
2楼2017-02-14 21:52:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

MD初学者

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 缘自阳光 at 2017-02-14 21:52:48
可以试试编程读入xtc轨迹文件，然后按照要求格式写成.nc文件。

没有什么软件是直接可以用的吗
赞一下 回复此楼
3楼2017-02-15 08:55:06
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

缘自阳光

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
3楼: Originally posted by MD初学者 at 2017-02-15 08:55:06
没有什么软件是直接可以用的吗...

抱歉我没用过Gromacs,不知道具体有什么软件可用，但lammps和NAMD等轨迹文件都是比较简单的，编程处理一下应该不难。
赞一下(1人) 回复此楼
4楼2017-02-15 11:34:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 6 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭