应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » 轨迹文件形式转化问题
北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
51/1返回列表
查看: 2051  |  回复: 5
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

MD初学者

新虫 (初入文坛)

[求助] 轨迹文件形式转化问题

想问一下Gromacs模拟生成的xtc轨迹文件如何转化为nMoldyn可以分析的.nc文件？谢谢。
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2017-02-14 15:43:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

缘自阳光

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
3楼: Originally posted by MD初学者 at 2017-02-15 08:55:06
没有什么软件是直接可以用的吗...

抱歉我没用过Gromacs,不知道具体有什么软件可用，但lammps和NAMD等轨迹文件都是比较简单的，编程处理一下应该不难。
赞一下(1人) 回复此楼
4楼2017-02-15 11:34:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 6 个回答

缘自阳光

新虫 (初入文坛)
可以试试编程读入xtc轨迹文件，然后按照要求格式写成.nc文件。
赞一下 回复此楼
2楼2017-02-14 21:52:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

MD初学者

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 缘自阳光 at 2017-02-14 21:52:48
可以试试编程读入xtc轨迹文件，然后按照要求格式写成.nc文件。

没有什么软件是直接可以用的吗
赞一下 回复此楼
3楼2017-02-15 08:55:06
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

MD初学者

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
4楼: Originally posted by 缘自阳光 at 2017-02-15 11:34:03
抱歉我没用过Gromacs,不知道具体有什么软件可用，但lammps和NAMD等轨迹文件都是比较简单的，编程处理一下应该不难。...

嗯，好的，谢谢
回复此楼
5楼2017-02-15 11:56:33
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 6 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 一志愿211 初试270分 求调剂 +8 谷雨上岸 2026-03-23 9/450 2026-03-29 01:00 by 我是小康
[考研] 0703 化学 求调剂，一志愿山东大学 342 分 +4 Shern—- 2026-03-28 4/200 2026-03-29 00:47 by 544594351
[考研] 394求调剂 +3 好事多磨静候佳� 2026-03-26 5/250 2026-03-28 14:24 by 唐沐儿
[考研] 346求调剂 一志愿070303有机化学 +3 萝卜炖青菜 2026-03-28 3/150 2026-03-28 14:11 by 唐沐儿
[考研] 317求调剂 +6 十闲wx 2026-03-24 6/300 2026-03-28 13:27 by Iveryant
[考研] 求调剂 +8 张zz111 2026-03-27 9/450 2026-03-28 03:41 by fmesaito
[考研] 275求调剂 +10 jjjjjjjjjjl 2026-03-27 10/500 2026-03-27 23:47 by barnett0632
[考博] 26申博 +3 加油冲啊！ 2026-03-26 3/150 2026-03-27 15:38 by cls512
[考研] 307求调剂 +8 超级伊昂大王 2026-03-24 9/450 2026-03-27 15:34 by 超级伊昂大王
[考研] 一志愿211，335分，0856，求调剂院校和导师 +4 倾____萧 2026-03-27 5/250 2026-03-27 11:52 by zhshch
[考研] 324求调剂 +5 hanamiko 2026-03-26 5/250 2026-03-27 10:33 by wangjy2002
[考研] 286求调剂 +4 lim0922 2026-03-26 4/200 2026-03-27 10:28 by guoweigw
[考研] 341求调剂 +7 青柠檬1 2026-03-26 7/350 2026-03-27 00:19 by wxiongid
[考研] 085602 289分求调剂 +8 WWW西西弗斯 2026-03-24 8/400 2026-03-26 16:33 by 不吃魚的貓
[考研] 一志愿哈工大，085400，320，求调剂 +4 gdlf9999 2026-03-24 4/200 2026-03-25 23:01 by boxking200
[考研] 293求调剂 +7 加一一九 2026-03-24 7/350 2026-03-25 12:02 by userper
[考研] 289材料与化工（085600）B区求调剂 +4 这么名字咋样 2026-03-22 5/250 2026-03-25 08:20 by mx.yue
[考研] 调剂 +4 13853210211 2026-03-24 4/200 2026-03-24 19:44 by ms629
[考研] 292求调剂 +4 鹅鹅鹅额额额额� 2026-03-24 4/200 2026-03-24 16:41 by peike
[考研] 一志愿国科过程所081700，274求调剂 +3 三水研0水立方 2026-03-23 3/150 2026-03-23 23:11 by MajorWen
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭