24小时热门版块排行榜    

查看: 1993  |  回复: 5

MD初学者

新虫 (初入文坛)

[求助] 轨迹文件形式转化问题

想问一下Gromacs模拟生成的xtc轨迹文件如何转化为nMoldyn可以分析的.nc文件?谢谢。
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

缘自阳光

新虫 (初入文坛)

可以试试编程读入xtc轨迹文件,然后按照要求格式写成.nc文件。
2楼2017-02-14 21:52:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

MD初学者

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 缘自阳光 at 2017-02-14 21:52:48
可以试试编程读入xtc轨迹文件,然后按照要求格式写成.nc文件。

没有什么软件是直接可以用的吗
3楼2017-02-15 08:55:06
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

缘自阳光

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by MD初学者 at 2017-02-15 08:55:06
没有什么软件是直接可以用的吗...

抱歉我没用过Gromacs,不知道具体有什么软件可用,但lammps和NAMD等轨迹文件都是比较简单的,编程处理一下应该不难。
4楼2017-02-15 11:34:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

MD初学者

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 缘自阳光 at 2017-02-15 11:34:03
抱歉我没用过Gromacs,不知道具体有什么软件可用,但lammps和NAMD等轨迹文件都是比较简单的,编程处理一下应该不难。...

嗯,好的,谢谢
5楼2017-02-15 11:56:33
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

MD初学者

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 缘自阳光 at 2017-02-15 11:34:03
抱歉我没用过Gromacs,不知道具体有什么软件可用,但lammps和NAMD等轨迹文件都是比较简单的,编程处理一下应该不难。...

嗯,好的,谢谢
6楼2017-02-15 20:30:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 学员uYvEGW 的主题更新
信息提示
请填处理意见