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猫仔鹿鹿

铁虫 (小有名气)

[求助] 求助各位大神,MS中构建HZSM-5模型问题 已有1人参与

请问大神,MS中构建HZSM-5模型时,用Al取代了一个MFI晶胞中的Si原子,然后用H+平衡电荷。这个过程中采用sorption模块中Locate任务优化H+的位置,发现结构最低能量时H+位置偏离Al原子很远,这个是什么原因呢?  力场采用cvff,每个原子均赋予了力场,修改了电荷。

或者可以采取其他办法得到优化结构?我看文献有采用MD模拟退火方式进行构型优化,不知有什么区别?
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周先森回家了

金虫 (著名写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 猫仔鹿鹿 at 2016-12-14 15:11:16
这里H的位置我没有直接手动加上去的,而是透过locate任务优化的位置。  如果直接加上去用模拟退火方式优化的话也会有一个结果,但是感觉好像没这么简单吧...

我当时是直接加上去的 然后又做的优化
尽自己最大的努力朝着正确的方向去做,远离拖延症~(2016-12-12)
4楼2016-12-14 16:56:34
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普通回帖

周先森回家了

金虫 (著名写手)

用H平衡电荷的时候,H不是连接在了与Al相连的O原子上吗?你说的H位置偏离Al原子很远,我没太明白是什么意思
尽自己最大的努力朝着正确的方向去做,远离拖延症~(2016-12-12)
2楼2016-12-14 10:13:04
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猫仔鹿鹿

铁虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 周先森回家了 at 2016-12-14 10:13:04
用H平衡电荷的时候,H不是连接在了与Al相连的O原子上吗?你说的H位置偏离Al原子很远,我没太明白是什么意思

这里H的位置我没有直接手动加上去的,而是透过locate任务优化的位置。  如果直接加上去用模拟退火方式优化的话也会有一个结果,但是感觉好像没这么简单吧
3楼2016-12-14 15:11:16
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Ronny_chou

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
用Locate做好像里面就有退火的步骤,如果你仔细看的话,有没有可能弛豫时间不够?
5楼2016-12-15 08:39:04
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pigrass

专家顾问 (著名写手)

伊卡斯特的小猪

附件是吸附了吡啶的HZSM-5,不知道删掉吡啶后是不是就是你要的

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#有问题发论坛,不接受私聊#爱晶体,爱MaterialsStudio#MS专辑点击右边#http://emuch.net/taotie/41673.html#物性数据#http://webbook.nist.gov/chemistry/#
6楼2016-12-16 09:06:22
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child-free

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 周先森回家了 at 2016-12-14 10:13:04
用H平衡电荷的时候,H不是连接在了与Al相连的O原子上吗?你说的H位置偏离Al原子很远,我没太明白是什么意思

你好,我最近也遇到这个问题,我是通过将氢加到Al原子附近的氧原子上的,然后通过Forcite模块进行结合优化的,但我不是很确定结构是否正确,能否交流一下?
7楼2017-05-04 09:09:21
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child-free

新虫 (初入文坛)

楼主,你的问题解决了吗,我也遇到同样的问题,可否一起交流一下?
8楼2017-05-04 09:11:02
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周先森回家了

金虫 (著名写手)

引用回帖:
7楼: Originally posted by child-free at 2017-05-04 09:09:21
你好,我最近也遇到这个问题,我是通过将氢加到Al原子附近的氧原子上的,然后通过Forcite模块进行结合优化的,但我不是很确定结构是否正确,能否交流一下?...

我不了解你说的MS中的模块,我只用MS建个模型,用vasp计算

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尽自己最大的努力朝着正确的方向去做,远离拖延症~(2016-12-12)
9楼2017-05-04 11:29:51
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周先森回家了

金虫 (著名写手)

引用回帖:
7楼: Originally posted by child-free at 2017-05-04 09:09:21
你好,我最近也遇到这个问题,我是通过将氢加到Al原子附近的氧原子上的,然后通过Forcite模块进行结合优化的,但我不是很确定结构是否正确,能否交流一下?...

结构正确与否还是找相关的文献吧,大家体系不一样 ~

发自小木虫Android客户端
尽自己最大的努力朝着正确的方向去做,远离拖延症~(2016-12-12)
10楼2017-05-04 11:30:37
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