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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » LAMMPS/DL_POLY » 虽然是月经贴，但是一直没有搞定msi2lmp工具，所以只能向各位求助了
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qsandy

新虫 (小有名气)

[求助] 虽然是月经贴，但是一直没有搞定msi2lmp工具，所以只能向各位求助了 已有3人参与

如何把模型从MS软件移植到Lammps平台，这个问题我在论坛里搜索出来了好多，的确也学习到了很多知识，无奈转换中还是有一步一直没成功，也找不到问题所在，只能发帖向各位分子模拟的大神求助了。

现在问题是我输入生成data文件的命令 ./msi2lmp.exe XXX -class I -frc cvff>data.XXX 后，终端里提示：
Warning: type name overflow for 'hspc
'. Truncating to 4 characters.
Warning: type name overflow for 'htip
'. Truncating to 4 characters.

同时生成的data文件，文件内容如下：
Running msi2lmp v3.9.7 / 24 Oct 2015

Forcefield: Class I
Forcefield file name: ../frc_files/cvff.frc
Output is recentered around geometrical center
Output contains style flag hints
System translated by: 0 0 0
Reading car file: XXX.car
Reading mdf file:XXX.mdf

Building internal coordinate lists

Reading forcefield file

Get force field parameters for this system
Unable to find mass for c4
论坛里有人出现过同样问题，不过解决方法没有找到。
转化文件这个问题研究几个礼拜了，人都快抓狂了，希望大神给予帮助，谢谢！
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1楼 2016-01-28 21:26:38
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匿名

感谢参与，应助指数 +1
本帖仅楼主可见
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2楼2016-01-28 22:06:22
已阅   申请模拟EPI   回复此楼   编辑   查看我的主页

qsandy

新虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by teller3531 at 2016-01-28 22:06:22
你ms导出文件typing成功了吗，我也用msi2lmp。exe转换文件都成功了

谢谢回复！
分子模拟我是新手，请问typing指的是什么操作？之前恶补的帖子里没看到过。
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3楼2016-01-28 22:28:01
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qsandy

新虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by teller3531 at 2016-01-28 22:06:22
你ms导出文件typing成功了吗，我也用msi2lmp。exe转换文件都成功了

做过typing操作后还是同样的问题。。。
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4楼2016-01-28 23:06:18
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mz121

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

加上-ignor ,再手工编辑一下
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» 本帖已获得的红花（最新10朵）

qsandy
5楼2016-02-24 23:38:43
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qsandy

新虫 (小有名气)
送红花一朵
引用回帖:
5楼: Originally posted by mz121 at 2016-02-24 23:38:43
加上-ignor ,再手工编辑一下

谢谢你的回复，我试过之后果然可以了！

发自小木虫Android客户端
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6楼2016-02-24 23:44:13
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竹韵飘香

金虫 (正式写手)
这两天也遇到同样问题，请问解决了吗？

发自小木虫Android客户端
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7楼2016-02-26 20:11:42
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theviza

至尊木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

我没有用msi2lmp工具
因为键角什么的信息对我的计算来说是多余的
我得到data文件的方法是
ms导出cif→vesta导出vasp
再用脚本vasp→data
脚本在这
↓↓↓↓↓↓↓↓↓↓↓↓
http://www.52souji.net/vasp-poscar2lammps-format-convert/
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8楼2016-03-01 10:31:03
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qsandy

新虫 (小有名气)
引用回帖:
7楼: Originally posted by 竹韵飘香 at 2016-02-26 20:11:42
这两天也遇到同样问题，请问解决了吗？

mz121的回复可以解决这个问题。即加上-ignore
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9楼2016-03-01 15:55:33
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黑曼小巴

新虫 (小有名气)
楼主你好，我在转换过程中也遇到问题了，我输入./msi2lmp.exe XXX -class I -frc cvff>data.XXX这段后，终端没有反应，然后生成了一个data文件，打开后里面写cannot open xx.car，请问是我的car文件本身有问题吗
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10楼2016-03-06 21:37:00
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