24小时热门版块排行榜

>论坛更新日志 (1783)
>虫友互识 (144)
>导师招生 (28)
>论文道贺祈福 (21)
>文献求助 (20)
>论文投稿 (20)
>基金申请 (19)
>考博 (15)
>教师之家 (14)
>公派出国 (14)
>考研 (13)
>休闲灌水 (13)
>硕博家园 (11)
>找工作 (9)
>博后之家 (7)
>海外博后 (2)

返回列表

当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

jianjunjiang

铁杆木虫 (正式写手)

应助: 4 (幼儿园)
金币: 8778.2
散金: 60
红花: 1
帖子: 925
在线: 250.3小时
虫号: 509147
注册: 2008-02-22
性别: GG
专业: 凝聚态物性 II ：电子结构

[求助] gromacs运算如何对某些水分子实行位置限制已有1人参与

各位大侠：
假设利用gromacs模拟时共有10个水分子，如果我想对其中的任意几个水分子（比如说，1，3，4个水分子）实行位置限制，可以怎样限制呢？

回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

分子模拟

» 猜你喜欢

拟解决的关键科学问题还要不要写已经有8人回复
26申博已经有3人回复
存款400万可以在学校里躺平吗已经有22人回复
最失望的一年已经有4人回复
国自然申请面上模板最新2026版出了吗？已经有19人回复
请教限项目规定已经有3人回复
基金委咋了？2026年的指南还没有出来？已经有10人回复
基金申报已经有6人回复
推荐一本书已经有13人回复
疑惑？已经有5人回复

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:

1楼 2016-12-10 20:01:52

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

月灯三昧

金虫 (小有名气)

应助: 0 (幼儿园)
金币: 1596.8
散金: 12
帖子: 157
在线: 94.8小时
虫号: 2742236
注册: 2013-10-21
专业: 化学工程及工业化学

引用回帖:

6楼: Originally posted by LeeGenuine at 2016-12-27 16:58:14
把这个分子的itp文件copy成两个，修改一下itp文件的，比如A和B，分别对应A.itp和B.itp。在A.itp文件中添加，B.itp中不添加。这样处理后，A和B分子是完全一样的，只是一个位置限定，一个不限定。最后在top文件中最后 ...

最近我也遇到类似的问题，尝试了楼上方式，但是出现了重复定义的报错，请问这可能是什么原因呢？