| 查看: 5812 | 回复: 14 | ||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | ||
shuting1994新虫 (小有名气)
|
[求助]
Lammps并行速度比串行速度慢很多，是什么原因呢？ 已有3人参与
|
|
|
自己在服务器上安装的并行lammps，以一个4千原子1万步的脚本为例子，发现并行输入mpirun -n 28 lmp_mpi < in.text. 输出log里显示1 by 14 by 2 mpi processor grid ,说明应该是并行计算了，结果算了32分19秒；同样的脚本我输入串行lmp_serial < in.bn，结果2分08秒就算出来了，心塞的不行，请问有哪位高手知道这是什么原因？多谢 发自小木虫Android客户端 |
回复此楼» 猜你喜欢
梦想
已经有7人回复
-
学科评审组评审是指会评吗？
已经有4人回复
-
面上合作单位盖章
已经有8人回复
-
面上函评意见出来了，像什么等级？
已经有15人回复
-
为什么资助数各大高校都创新高，自己申请怎么就这么难
已经有14人回复
-
小白求助 投论文要求的highlights应该如何写
已经有4人回复
-
麻烦专家们看看评委们的意见（F口面上）
已经有12人回复
-
怎么看青基中了没有啊
已经有6人回复
-
国社科又开始会评了，不知道这次命运如何
已经有11人回复
-
有多少人是今天查系统知道结果的？
已经有19人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 基因测序5年增速500倍！摩尔定律怎么办？
已经有1人回复
- lammps编译好的并行程序可以放在另一台电脑直接用吗？
已经有0人回复
- fix deposit沉积原子被反弹
已经有11人回复
- lammps并行调用不了多个核
已经有3人回复
- 并行计算通信方式
已经有3人回复
- 关于towhee 回答zhang_jaj的问题
已经有44人回复
- 【求助】Lammps 多机并行的问题
已经有11人回复
abinitio
版主 (著名写手)
- 模拟EPI: 2
- 应助: 221 (大学生)
- 贵宾: 0.093
- 金币: 7365.2
- 散金: 3917
- 红花: 57
- 帖子: 1317
- 在线: 485.2小时
- 虫号: 368545
- 注册: 2007-05-11
- 性别: GG
- 专业: 凝聚态物性I:结构、力学和
- 管辖: 分子模拟
|
我没说清楚，是运行时的屏幕显示信息，一般都通过> 或get 重定向到一个文件里，里面有关于comm time的比例。 Pair time (%) = 682.588 (58.6658) Neigh time (%) = 1.25649 (0.10799) Comm time (%) = 401.952 (34.5463) Outpt time (%) = 0.3374 (0.0289982) Other time (%) = 77.3855 (6.65098) |
shuting19949楼2016-12-05 08:07:49
abinitio
版主 (著名写手)
- 模拟EPI: 2
- 应助: 221 (大学生)
- 贵宾: 0.093
- 金币: 7365.2
- 散金: 3917
- 红花: 57
- 帖子: 1317
- 在线: 485.2小时
- 虫号: 368545
- 注册: 2007-05-11
- 性别: GG
- 专业: 凝聚态物性I:结构、力学和
- 管辖: 分子模拟
2楼2016-12-01 08:29:16
3楼2016-12-02 09:43:21
★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
shuting1994: 金币+5, ★★★★★最佳答案 2016-12-02 19:46:04
感谢参与，应助指数 +1
shuting1994: 金币+5, ★★★★★最佳答案 2016-12-02 19:46:04
|
本帖内容被屏蔽 |
4楼2016-12-02 12:31:38
5