24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
汕头大学海洋科学接受调剂
查看: 5514  |  回复: 14
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

shuting1994

新虫 (小有名气)

[求助] Lammps并行速度比串行速度慢很多,是什么原因呢? 已有3人参与

自己在服务器上安装的并行lammps,以一个4千原子1万步的脚本为例子,发现并行输入mpirun -n 28 lmp_mpi < in.text. 输出log里显示1 by 14 by 2 mpi processor grid ,说明应该是并行计算了,结果算了32分19秒;同样的脚本我输入串行lmp_serial < in.bn,结果2分08秒就算出来了,心塞的不行,请问有哪位高手知道这是什么原因?多谢

发自小木虫Android客户端
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

abinitio

版主 (著名写手)

引用回帖:
5楼: Originally posted by shuting1994 at 2016-12-02 19:43:44
我还是新手,是用的SSH端口连接的服务器,这里我只能从log文件里看到计算总时间,请问comm time应该从哪里看到呢?
...

我没说清楚,是运行时的屏幕显示信息,一般都通过> 或get 重定向到一个文件里,里面有关于comm time的比例。

Pair  time (%) = 682.588 (58.6658)
Neigh time (%) = 1.25649 (0.10799)
Comm  time (%) = 401.952 (34.5463)
Outpt time (%) = 0.3374 (0.0289982)
Other time (%) = 77.3855 (6.65098)

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

9楼2016-12-05 08:07:49
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 15 个回答

abinitio

版主 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
看看log文件里的comm time 占百分比是多少?

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

2楼2016-12-01 08:29:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

y.q.liu

金虫 (小有名气)


【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
建议你做些其它核数的测试,比如2 4  8 等看看,有的确实核数多反而慢的

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

3楼2016-12-02 09:43:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gredream

禁虫 (正式写手)

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
shuting1994: 金币+5, ★★★★★最佳答案 2016-12-02 19:46:04
本帖内容被屏蔽

4楼2016-12-02 12:31:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 本科郑州大学,一志愿华东师范大学282求调剂 +27 熊哥xtk 2026-04-07 32/1600 2026-04-13 15:18 by xhd3152
[考研] 调剂 +26 不逢春 2026-04-07 27/1350 2026-04-13 14:24 by 张zhihao
[考研] 材料299专硕求调剂 +13 +21 2026-04-09 13/650 2026-04-13 14:16 by 张zhihao
[考研] 314求调剂 +24 wakeluofu 2026-04-09 25/1250 2026-04-13 08:58 by lhj2009
[基金申请] 2026 WR青拔 +3 liuchb715 2026-04-09 5/250 2026-04-13 08:46 by 小_小_白虫
[考研] 一志愿中南大学 0855 机械 286 求调剂 +10 不会吃肉 2026-04-12 10/500 2026-04-12 22:51 by 零零二
[考研] 一志愿华中农微生物,288分,三年实验经历 +11 代fish 2026-04-09 11/550 2026-04-12 10:21 by Hayaay
[考研] 求调剂 +18 MAX怅惘 2026-04-09 20/1000 2026-04-11 23:31 by zhen~
[考研] 296求调剂 +14 汪!?! 2026-04-08 15/750 2026-04-11 20:28 by dongdian1
[考研] 346,工科求调剂 +3 moser233 2026-04-09 3/150 2026-04-11 10:04 by zhq0425
[考研] 085506-求调剂-285分 +3 雷欧飞踢 2026-04-08 3/150 2026-04-11 08:37 by zhq0425
[考研] 302分求调剂 +9 凡语祈愿 2026-04-08 10/500 2026-04-10 23:26 by 314126402
[考研] 289 分105500药学专硕求调剂(找B区学校) +6 白云123456789 2026-04-09 8/400 2026-04-10 21:13 by zhouxiaoyu
[考研] 293调剂 +25 yj1221 2026-04-08 26/1300 2026-04-10 15:02 by 柴小白
[考研] 青岛科技大学材料学院,环境学院调剂补录4月10日以前都可以 +3 1青科大。 2026-04-09 5/250 2026-04-10 09:58 by 翩翩一书生
[考研] 初试分332,一志愿报考西北工业大学, +11 故人?? 2026-04-09 11/550 2026-04-09 21:54 by JineShine
[考研] 367求调剂 +10 hffQAQ 2026-04-09 10/500 2026-04-09 18:06 by lijunpoly
[考研] 一志愿吉大化学327求调剂 +12 王王白石 2026-04-06 13/650 2026-04-08 16:05 by luoyongfeng
[考研] 388求调剂 +6 四川王涛 2026-04-07 8/400 2026-04-08 00:17 by JourneyLucky
[考研] 333求调剂 +6 合乘杨习夕 2026-04-06 6/300 2026-04-07 09:44 by 猪会飞
信息提示
请填处理意见