24小时热门版块排行榜    

北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
查看: 5471  |  回复: 14
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

shuting1994

新虫 (小有名气)

[求助] Lammps并行速度比串行速度慢很多,是什么原因呢? 已有3人参与

自己在服务器上安装的并行lammps,以一个4千原子1万步的脚本为例子,发现并行输入mpirun -n 28 lmp_mpi < in.text. 输出log里显示1 by 14 by 2 mpi processor grid ,说明应该是并行计算了,结果算了32分19秒;同样的脚本我输入串行lmp_serial < in.bn,结果2分08秒就算出来了,心塞的不行,请问有哪位高手知道这是什么原因?多谢

发自小木虫Android客户端
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

shuting1994

新虫 (小有名气)

送红花一朵
引用回帖:
9楼: Originally posted by abinitio at 2016-12-05 08:07:49
我没说清楚,是运行时的屏幕显示信息,一般都通过> 或get 重定向到一个文件里,里面有关于comm time的比例。

Pair  time (%) = 682.588 (58.6658)
Neigh time (%) = 1.25649 (0.10799)
Comm  time (%) = 4 ...

比方说我在提交任务的时候,可以这样mpirun -n  核数 lmp_mpi < in.text >out.put,然后在在out.put文件里查看时间信息吗?还是你的服务器里安装了类似pbs之类的提交软件,可以在输出文件里查看时间信息呢?~

发自小木虫Android客户端
10楼2016-12-05 11:58:52
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 15 个回答

abinitio

版主 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
看看log文件里的comm time 占百分比是多少?

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

2楼2016-12-01 08:29:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

y.q.liu

金虫 (小有名气)


【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
建议你做些其它核数的测试,比如2 4  8 等看看,有的确实核数多反而慢的

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

3楼2016-12-02 09:43:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gredream

禁虫 (正式写手)

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
shuting1994: 金币+5, ★★★★★最佳答案 2016-12-02 19:46:04
本帖内容被屏蔽

4楼2016-12-02 12:31:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 考研调剂 +4 Sanmu-124 2026-03-26 4/200 2026-03-27 17:49 by kiokin
[考研] 352分 化工与材料 +3 海纳百川Ly 2026-03-27 3/150 2026-03-27 17:18 by 杨杨杨紫
[考研] 085600材料与化工调剂 +10 A-哆啦Z梦 2026-03-23 16/800 2026-03-27 15:13 by caszguilin
[考研] 化学308分求调剂 +8 你好明天你好 2026-03-23 9/450 2026-03-27 14:01 by 杨光于青云
[考研] 一志愿211,335分,0856,求调剂院校和导师 +4 倾____萧 2026-03-27 5/250 2026-03-27 11:52 by zhshch
[考研] 359求调剂 +4 王了个楠 2026-03-25 4/200 2026-03-27 08:43 by 不吃魚的貓
[考研] 求调剂,一志愿 南京航空航天大学大学 ,080500材料科学与工程学硕 +4 @taotao 2026-03-26 5/250 2026-03-27 08:10 by hypershenger
[考研] 一志愿厦门大学化学学硕307求调剂 +8 y7czhao 2026-03-26 8/400 2026-03-26 19:51 by 不吃魚的貓
[考研] 340求调剂 +3 Amber00 2026-03-26 3/150 2026-03-26 18:57 by 不吃魚的貓
[考研] 一志愿211 初试270分 求调剂 +6 谷雨上岸 2026-03-23 7/350 2026-03-26 18:55 by 不吃魚的貓
[考研] 一志愿河工大 081700 276求调剂 +4 地球绕着太阳转 2026-03-23 4/200 2026-03-26 14:27 by zzll406
[考研] 263求调剂 +6 yqdszhdap- 2026-03-22 10/500 2026-03-26 13:11 by 公瑾逍遥
[考研] 0854电子信息求调剂 324 +4 Promise-jyl 2026-03-23 4/200 2026-03-25 11:36 by Sugarlight
[考研] 289材料与化工(085600)B区求调剂 +4 这么名字咋样 2026-03-22 5/250 2026-03-25 08:20 by mx.yue
[考研] 291求调剂 +3 HanBeiNingZC 2026-03-24 3/150 2026-03-24 16:34 by barlinike
[考研] 一志愿吉大化学322求调剂 +4 17501029541 2026-03-23 6/300 2026-03-24 10:21 by 戴围脖的小蚊子
[考研] 一志愿河北工业大学0817化工278分求调剂 +7 jhybd 2026-03-23 12/600 2026-03-24 09:03 by jhybd
[考研] 361求调剂 +3 Glack 2026-03-22 3/150 2026-03-23 22:03 by fuyu_
[考研] 求调剂 +5 Zhangbod 2026-03-21 7/350 2026-03-22 13:13 by Zhangbod
[考研] 求调剂 +4 要好好无聊 2026-03-21 4/200 2026-03-21 18:57 by 学员8dgXkO
信息提示
请填处理意见