24小时热门版块排行榜    

查看: 801  |  回复: 4

等我apple

铜虫 (初入文坛)

[交流] 进化树相关问题 已有2人参与

请教大神们,初入生物信息学的菜鸟,表述不准确,请见谅!细菌和真菌建立进化树时一般选择那种方法建树,NJ,ML?还有就是单个菌株建树完毕后,怎么综合起来建树呢?

发自小木虫Android客户端
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

rainboy3529

铁虫 (著名写手)


xn8008: 金币+1, 欢迎发帖交流 2016-11-02 07:57:46
xn8008: 应助指数+1 2016-11-02 07:57:56

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

2楼2016-11-01 23:48:06
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

等我apple

铜虫 (初入文坛)

为什么我的进化树建好后自检数值非常低呢?

发自小木虫Android客户端
3楼2016-11-03 22:47:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

等我apple

铜虫 (初入文坛)

送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by rainboy3529 at 2016-11-01 23:48:06
最常用NJNJ

请问,为什么我的进化树建好后,自检数值很小呢?您可否分析下原因?谢谢

发自小木虫Android客户端
4楼2016-11-04 22:02:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

黑藻先生

银虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
ML一般多用于DNA NJ只是比较快可能蛋白好一些
但是如果你真的要做不建议用MEGA也不建议用NJ 具体请根据你自己数据的情况来定

网上有的是这些算法的比较的文献 稍微看看就会知道


BOOTSTRAP值低说明你序列相似度低 所选的MARKER可能有问题
况且如果你跨原核真核 不一样是很正常的应该
5楼2016-11-09 22:47:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 等我apple 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 面上意见出来了 +6 黄鸟于飞Chao 2026-08-29 10/500 2026-08-29 15:50 by 微不足道士
[公派出国] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +3 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 5/250 2026-08-29 14:23 by jCd0dEvKHShX
[考博] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +4 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 7/350 2026-08-29 14:15 by jCd0dEvKHShX
[基金申请] 麻烦专家们看看评委们的意见(F口面上) +5 gdd2018 2026-08-28 10/500 2026-08-29 14:10 by Jacob678
[公派出国] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +3 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 4/200 2026-08-29 14:02 by jCd0dEvKHShX
[教师之家] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +4 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 5/250 2026-08-29 11:49 by jCd0dEvKHShX
[考研] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +4 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 6/300 2026-08-29 11:40 by jCd0dEvKHShX
[找工作] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 6/300 2026-08-29 11:29 by jCd0dEvKHShX
[考研] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +6 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 9/450 2026-08-29 11:18 by jCd0dEvKHShX
[基金申请] 国自然面上复盘~欢迎讨论 (金币+15) +14 晴天加油 2026-08-26 15/750 2026-08-29 11:06 by biily
[基金申请] 我就是申请一个面上项目而已,这评审意见是按照杰青的条件评的吧? +6 gouxfjh 2026-08-28 9/450 2026-08-29 09:59 by jklily
[基金申请] 有没有仍没收到信息的 +3 德尚中行 2026-08-27 3/150 2026-08-28 15:24 by rongshuxia
[基金申请] 基金不中,共勉 +11 eulota 2026-08-26 11/550 2026-08-28 14:22 by 火星超人xi
[基金申请] 申请删除本帖 +6 lyz123lyz 2026-08-27 7/350 2026-08-27 17:31 by 宁静致远sy
[基金申请] 怎么看青基中了没有啊 +5 叶九微 2026-08-26 5/250 2026-08-27 10:35 by l_zh2008
[基金申请] 2026年8月25日国自然放榜前突然收到列入评审专家邮件,有关系吗? +25 木水思豆 2026-08-25 28/1400 2026-08-26 14:53 by draco1987
[基金申请] 出来了 +9 trojank 2026-08-26 9/450 2026-08-26 14:25 by 宝贝虫子
[基金申请] 国际合作可查了,中了面上 (EPI+1)(金币+50) +18 Ldrop2023 2026-08-26 18/900 2026-08-26 11:15 by cmrandy
[基金申请] 系统进不去 +4 yanglien 2026-08-26 5/250 2026-08-26 11:10 by wenfengw83
[基金申请] 在坚冰还盖着北海的时候,我看到了怒放的梅花。 (金币+10) +6 ziyangfang 2026-08-25 9/450 2026-08-25 20:26 by huagongfeihu
信息提示
请填处理意见