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18354255512

新虫 (小有名气)

[求助] 载体构建 已有5人参与

构建载体过程中,将我的目的片段大约1000bp连接到pcambia1302载体上,挑的克隆做菌落pcr带很亮,但测序一直无信号,已经做了一个多月了,重新连接转化了好几次了,都是无信号,是怎么回事啊?求大神指点

@biostar2009 发自小木虫Android客户端
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王平阳

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
xn8008: 金币+1, 欢迎发帖交流 2016-07-21 12:59:47
不知道你测序是自己做的还是公司做的,测序引物是什么?
测序没有信号一般就两个原因,一是测序引物在质粒上没有匹配序列,即质粒构建错误或者测序引物不对,既然你的菌P没有问题,建议采用你做菌P的引物测序,上下游做一个双向测,如还需要载体上序列,可以采用步移法测序;另一个可能的原因就是质粒污染,测序峰非常混乱,从而表现出无信号,你既然做了很多次,这个应该可以排除。祝你好运!
没有做不到,只有想不到!
2楼2016-07-21 09:56:16
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781055707

木虫 (著名写手)

引用回帖:
5楼: Originally posted by 18354255512 at 2016-07-21 11:19:06
双酶切没有做,不过假阳性率会那么高吗,每次菌pcr的带都挺亮的呀
...

那你要双酶切得呀,PCR对于有些片段是很容易产生气溶胶污染的。
采菊东篱下,悠然见南山。
6楼2016-07-21 16:48:29
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普通回帖

781055707

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
xn8008: 金币+1, 欢迎发帖交流 2016-07-21 12:59:54
你双酶切过吗,PCR假阳性也说不定的。
采菊东篱下,悠然见南山。
3楼2016-07-21 11:01:12
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18354255512

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 王平阳 at 2016-07-21 09:56:16
不知道你测序是自己做的还是公司做的,测序引物是什么?
测序没有信号一般就两个原因,一是测序引物在质粒上没有匹配序列,即质粒构建错误或者测序引物不对,既然你的菌P没有问题,建议采用你做菌P的引物测序,上下 ...

非常感谢你的提议,我是送公司做的,你所说的质粒污染是我测序送的质粒吗,还是构建过程中目的片段和载体的污染啊,不过我之前大多送的是菌液,就送过两次质粒,都测出来没信号

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4楼2016-07-21 11:17:24
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18354255512

新虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 781055707 at 2016-07-21 11:01:12
你双酶切过吗,PCR假阳性也说不定的。

双酶切没有做,不过假阳性率会那么高吗,每次菌pcr的带都挺亮的呀

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5楼2016-07-21 11:19:06
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小冀-

版主 (著名写手)

优秀版主优秀版主

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
你是怎么连的呀,双酶切、单酶切还是怎样,会不会出现双向的连接产物啊,这样的话可能没有信号
···
7楼2016-07-22 11:01:46
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feierorange

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
你的质粒没有酶切鉴定一下吗?菌落PCR的结果不一定可信
8楼2016-07-22 13:02:09
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18354255512

新虫 (小有名气)

引用回帖:
7楼: Originally posted by 小冀- at 2016-07-22 11:01:46
你是怎么连的呀,双酶切、单酶切还是怎样,会不会出现双向的连接产物啊,这样的话可能没有信号

双酶切的

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9楼2016-07-22 19:48:32
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风萧萧1028

新虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
肯定要提取质粒做双酶切验证啊!
10楼2016-07-22 21:30:43
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