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二八直人

金虫 (小有名气)

[求助] 分子对接与优化问题 已有1人参与

我想问一下各位大神,如果我的晶体是在有机溶剂(比如甲醇)中得到的,做分子对接时效果还行,但是拿去做生物实验时,晶体会放在培养基里,做出来显示没有活性,这是什么原因呢?会不会是放在两种溶剂中结构会改变?还有一个问题是,进行结构优化的时候能不能选择溶剂环境呢?
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pymol

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感谢参与,应助指数 +1
二八直人: 金币+30, ★★★很有帮助 2016-07-03 19:00:00
分子对接一般不考虑环境问题
2楼2016-07-02 13:20:29
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二八直人

金虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by pymol at 2016-07-02 13:20:29
分子对接一般不考虑环境问题

那是不是放在培养基里面的结构会改变呢?

发自小木虫Android客户端
3楼2016-07-03 00:09:10
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pymol

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引用回帖:
3楼: Originally posted by 二八直人 at 2016-07-03 00:09:10
那是不是放在培养基里面的结构会改变呢?
...

这个很难说,或许你的蛋白在特定PH条件下会发生构象变化
4楼2016-07-03 12:19:39
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