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yuguiyan

至尊木虫 (文坛精英)

[求助] 3'RACE没有连续的保守序列,怎么设计引物呀? 已有1人参与

已知一段序列,但比对发现跟别的物种只是断断续续的同源,找不到连续的一段保守区,我怎么设计引物呀?

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yuguiyan

至尊木虫 (文坛精英)

2楼2016-06-10 11:37:54
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yuguiyan

至尊木虫 (文坛精英)

3楼2016-06-10 11:46:55
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yuguiyan

至尊木虫 (文坛精英)

4楼2016-06-10 11:57:38
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yuguiyan

至尊木虫 (文坛精英)

5楼2016-06-10 12:08:54
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yuguiyan

至尊木虫 (文坛精英)

6楼2016-06-10 12:32:42
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yuguiyan

至尊木虫 (文坛精英)

7楼2016-06-10 12:57:22
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yuguiyan

至尊木虫 (文坛精英)

8楼2016-06-10 13:25:39
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xn8008

至尊木虫 (知名作家)

Balance Angel

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
利用你的这段序列设计引物,注意规你的引物需要避与其他物种的同源性,然后利用5'和3‘RACE扩增得到全长,之后利用你的全长mRNA序列设计引物,扩增得到DNA序列,之后含有内含子的DNA和RNA序列送到NCBI进行全库Blast,可以很好的验证序列的保守性,祝你好运
奋斗是我们前进的动力!
9楼2016-06-10 13:36:17
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yuguiyan

至尊木虫 (文坛精英)

引用回帖:
9楼: Originally posted by xn8008 at 2016-06-10 13:36:17
利用你的这段序列设计引物,注意规你的引物需要避与其他物种的同源性,然后利用5'和3‘RACE扩增得到全长,之后利用你的全长mRNA序列设计引物,扩增得到DNA序列,之后含有内含子的DNA和RNA序列送到NCBI进行全库Blast ...

我设计了两段,打算做巢式,请问你做过RACE吗

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10楼2016-06-10 13:58:41
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