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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » PCR相关 » 3'RACE没有连续的保守序列，怎么设计引物呀？
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yuguiyan

至尊木虫 (文坛精英)

[求助] 3'RACE没有连续的保守序列，怎么设计引物呀？ 已有1人参与

已知一段序列，但比对发现跟别的物种只是断断续续的同源，找不到连续的一段保守区，我怎么设计引物呀？

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1楼 2016-06-10 11:31:07
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yuguiyan

至尊木虫 (文坛精英)
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2楼2016-06-10 11:37:54
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yuguiyan

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3楼2016-06-10 11:46:55
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yuguiyan

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4楼2016-06-10 11:57:38
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yuguiyan

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5楼2016-06-10 12:08:54
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yuguiyan

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6楼2016-06-10 12:32:42
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yuguiyan

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7楼2016-06-10 12:57:22
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yuguiyan

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8楼2016-06-10 13:25:39
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xn8008

至尊木虫 (知名作家)

Balance Angel

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
利用你的这段序列设计引物，注意规你的引物需要避与其他物种的同源性，然后利用5'和3‘RACE扩增得到全长，之后利用你的全长mRNA序列设计引物，扩增得到DNA序列，之后含有内含子的DNA和RNA序列送到NCBI进行全库Blast，可以很好的验证序列的保守性，祝你好运
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奋斗是我们前进的动力！
9楼2016-06-10 13:36:17
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yuguiyan

至尊木虫 (文坛精英)
引用回帖:
9楼: Originally posted by xn8008 at 2016-06-10 13:36:17
利用你的这段序列设计引物，注意规你的引物需要避与其他物种的同源性，然后利用5'和3‘RACE扩增得到全长，之后利用你的全长mRNA序列设计引物，扩增得到DNA序列，之后含有内含子的DNA和RNA序列送到NCBI进行全库Blast ...

我设计了两段，打算做巢式，请问你做过RACE吗

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10楼2016-06-10 13:58:41
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