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MSD分析扩散系数的取值段
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MSD分析扩散系数的取值段
在MS中分析熔体中某一离子的扩散系数时,得到如下曲线。扩散系数等于曲线斜率的六分之一,但是这个曲线的斜率不是唯一的,请教一下怎么取值
862C.tmp.jpg
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1楼
2016-06-06 16:34:47
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lsloneil
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5楼
:
Originally posted by
brucefan
at 2016-06-05 22:21:51
我还是觉得你的数据反常。一般来说,msd一开始是关联时间的二次函数。随着关联时间的增加,会过渡到一次函数。你的msd的初始行为不大对劲。所以,我怀疑你计算msd的方法有问题。
...
谁说MSD一开始是时间的二次函数了? MSD一开始是一个subdiffusive behavior,代表粒子走出第一个溶剂笼的过程,在subdiffusion的过程中MSD和时间的关系根本不是你说的二次函数,而是小于一次函数,就像lz给出的图那样,讨论subdiffusion的论文很多,比如这两篇,都没出现你所说的那种MSD是时间二次函数的情况
http://www.cell.com/biophysj/abstract/S0006-3495(13)05802-5
http://journals.aps.org/prl/abst ... sRevLett.115.220601
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19楼
2016-06-14 15:32:45
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chuntao118
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怎么说那?你理解的扩散系数我认为是有点点问题的。尽管看公式的话是这个意思,但是这毕竟是一个统计过程,所以,应该是多次统计后去平均值吧!你在计算是要考虑模拟系统的大小吧?也就说统计的时间不应该足够的大。因为这个均方位移必须是有界的。具体的,你可以参考《The Art of Molecular Dynamics Simulation》的第五章。有详细的讨论。至于扩散系数会达到一个稳定值。若你的数据简单拟合的话。应该5-45之间的就行,建议你好好读读这本书的第五章。
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2楼
2016-06-06 17:00:07
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我感觉熔体还没有达到平衡状态,应该再增加弛豫时间。最后取达到平衡状态后的一段的斜率
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2016-06-06 18:14:11
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我是砖头(金币+1): 谢谢参与
我还是觉得你的数据反常。一般来说,msd一开始是关联时间的二次函数。随着关联时间的增加,会过渡到一次函数。你的msd的初始行为不大对劲。所以,我怀疑你计算msd的方法有问题。
[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
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5楼
2016-06-06 18:21:51
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