应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » MSD分析扩散系数的取值段
51/1返回列表
查看: 4200  |  回复: 20
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

我是砖头

银虫 (小有名气)

[交流] MSD分析扩散系数的取值段

在MS中分析熔体中某一离子的扩散系数时，得到如下曲线。扩散系数等于曲线斜率的六分之一，但是这个曲线的斜率不是唯一的，请教一下怎么取值

MSD分析扩散系数的取值段
862C.tmp.jpg
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

分子动力学模拟

» 本帖已获得的红花（最新10朵）

chuntao118

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:

» 抢金币啦！回帖就可以得到:

查看全部散金贴
1楼 2016-06-06 16:34:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

我是砖头

银虫 (小有名气)
引用回帖:
13楼: Originally posted by 707220828 at 2016-06-13 11:47:04
在计算MSD的时候出现，楼主有没有出现过不能分析 显示Mean square displacement analysis failed.
No time information is available for trajectories created by Annealed or Quenched dynamics.的情况。楼主知道 ...

我没有出现过这种情况，不介意的话把你怎么分析的以及你分析的窗口发我看一下
赞一下 回复此楼
14楼2016-06-13 16:05:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 21 个回答

chuntao118

新虫 (著名写手)
★
我是砖头(金币+1): 谢谢参与
送红花一朵
怎么说那？你理解的扩散系数我认为是有点点问题的。尽管看公式的话是这个意思，但是这毕竟是一个统计过程，所以，应该是多次统计后去平均值吧！你在计算是要考虑模拟系统的大小吧？也就说统计的时间不应该足够的大。因为这个均方位移必须是有界的。具体的，你可以参考《The Art of Molecular Dynamics Simulation》的第五章。有详细的讨论。至于扩散系数会达到一个稳定值。若你的数据简单拟合的话。应该5-45之间的就行，建议你好好读读这本书的第五章。
赞一下 回复此楼
2楼2016-06-06 17:00:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

abinitio

版主 (著名写手)
★
我是砖头(金币+1): 谢谢参与
我感觉熔体还没有达到平衡状态，应该再增加弛豫时间。最后取达到平衡状态后的一段的斜率
赞一下 回复此楼
4楼2016-06-06 18:14:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

brucefan

专家顾问 (著名写手)
★
我是砖头(金币+1): 谢谢参与
我还是觉得你的数据反常。一般来说，msd一开始是关联时间的二次函数。随着关联时间的增加，会过渡到一次函数。你的msd的初始行为不大对劲。所以，我怀疑你计算msd的方法有问题。

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
赞一下 回复此楼
5楼2016-06-06 18:21:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 21 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭