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guoxingjun2008

金虫 (正式写手)

[交流] 关于测序的问题!!

现在提取DNA要去测序,我们的程序是这样的:
  首先提取DNA,电泳检测;
  然后PCR扩增
  再把PCR扩增产物连接到T载体,接着转化感受态细胞,之后涂板,挑取白色菌落后就送去测序!

  请做过这方面的朋友,看看实验步骤有没有什么问题!
谢谢!
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WANGZHONGAC

至尊木虫 (正式写手)

挑的白色菌落应该还要鉴定一下吧
2楼2008-10-31 17:27:22
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guoxingjun2008

金虫 (正式写手)

我也认为是要把白色菌落挑取,提质粒鉴定一下,但是师姐说不用.因为我们做的这个不是蓝白板筛选,绝对不会有篮板出现,所以我现在也是不太懂,大家给我好好讲讲,把测序的步骤和过程给讲解一下吧,谢谢!
3楼2008-10-31 17:53:28
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chinosaur

木虫 (正式写手)

求购IQ卡

引用回帖:
Originally posted by WANGZHONGAC at 2008-10-31 17:27:
挑的白色菌落应该还要鉴定一下吧

我觉得这位仁兄说的对
挑的白色菌落也应该PCR鉴定一下,如果是用来表达蛋白还可以小量表达一下然后检测蛋白

我们用的也是抗生素挑选,不是蓝白斑

[ Last edited by chinosaur on 2008-11-9 at 11:15 ]
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4楼2008-11-09 11:14:45
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xjp13

金虫 (正式写手)

测序的步骤和过程相对麻烦了!交给专业公司不就OK,莫非你们有测序设备?
5楼2008-11-09 18:59:44
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sunjiali2005

银虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by WANGZHONGAC at 2008/10/31 17:27:
挑的白色菌落应该还要鉴定一下吧


应该PCR后跑个胶看一下,还可以根据设计的酶切位点做一下酶切鉴定
孙家利
6楼2008-11-09 19:08:39
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zhaoxiag

银虫 (小有名气)

我一般是挑抗性平板上单菌落提质粒,然后酶切验证,再加上个菌液PCR,再挑选正确的去测序,这样子准确率会高些,如果直接挑菌落去测序,要是碰上假阳性怎么办?感觉那样子就象在碰运气一样不太妥
7楼2008-11-09 23:05:28
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月月大可

木虫 (著名写手)

在平板上长出菌落后一定要挑去出来进行验证。不管你是用蓝白斑筛选还是用抗生素来筛选。
我们所使用的T载体都是在pUC质粒及基础上进行改造的出来的。生物制品公司把pUC质粒酶切开后在两端加上末端是T的接头,记住接头的添加率并非是百分之百!
平板筛选是可以使用菌落PCR也可以使用酶切验证。菌落PCR比较快,便于进行大量转化子的筛选,但是存在出现假阳性的可能性,使用菌落PCR一定做好阴性对照。酶切验证是很可靠的一种方法,但是你如果使用的是那种没有酶切位点的T载体就无法使用酶切法进行验证。
得到阳性克隆后在送公司测序前最后进行一次划线分离,确定你送去测序的是单克隆,当然从平板上挑去的但菌落大多数时候是单克隆但非绝对,如果你遇上不是单克隆的情况,你测序的峰会不好,影响你的测序结果!
测序现在大多数都是交给公司来做了,一个反应几十块钱,测序完发到你邮箱。快速方便。自己测序好像还得买试剂盒。
个人观点,仅供参考!
8楼2008-11-10 12:59:54
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wjswj

木虫 (正式写手)

小木虫领金币专业户

何必这么麻烦,还要做克隆?你有模板,有引物,直接提供给测序公司就好了。等着收序列就行了
金币是赌出来的
9楼2008-11-11 15:11:45
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guoxingjun2008

金虫 (正式写手)

呵呵,感谢各位的解答,还是自己做一下的好呀,以前没做过这方面的!
10楼2008-11-18 21:46:21
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