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baoyuan6969

金虫 (小有名气)

[求助] Gromacs做NPT模拟

最近用Gromacs做Ih冰的NPT模拟,设置温度和压力分别为 200K 和 1 bar,V-rescale控温 Parrinello-Rahman控压,跑了10ns,在output的最后的输出 平均压力为-6bar (如图), 求问大神这个可以接受不?以及改进的措施
另外做了一组10bar 和 100bar,最后的输出平均压力分别为 2.6bar 和92bar

Gromacs做NPT模拟
111.jpg
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凡天下事敢做敢为者为之。
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zhulilan

木虫 (小有名气)

请问你是怎么设置压力的?
专利代理师,北京集佳,出口方向
2楼2016-05-16 09:03:12
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baoyuan6969

金虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by zhulilan at 2016-05-16 09:03:12
请问你是怎么设置压力的?

Pcoupl=Parrinello-Rahman
ref_p = 1
凡天下事敢做敢为者为之。
3楼2016-05-16 16:21:45
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