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baoyuan6969

金虫 (小有名气)

[求助] Gromacs做NPT模拟

最近用Gromacs做Ih冰的NPT模拟，设置温度和压力分别为 200K 和 1 bar，V-rescale控温 Parrinello-Rahman控压，跑了10ns，在output的最后的输出 平均压力为-6bar (如图), 求问大神这个可以接受不？以及改进的措施
另外做了一组10bar 和 100bar，最后的输出平均压力分别为 2.6bar 和92bar

Gromacs做NPT模拟
111.jpg
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凡天下事敢做敢为者为之。
1楼 2016-05-16 06:24:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhulilan

木虫 (小有名气)
请问你是怎么设置压力的？
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专利代理师，北京集佳，出口方向
2楼2016-05-16 09:03:12
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baoyuan6969

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by zhulilan at 2016-05-16 09:03:12
请问你是怎么设置压力的？

Pcoupl=Parrinello-Rahman
ref_p = 1
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凡天下事敢做敢为者为之。
3楼2016-05-16 16:21:45
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