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G号糖

木虫 (正式写手)

[求助] 荧光定量PCR 已有3人参与

最近要做某细菌的一个基因相对表达量,采用荧光定量pcr,现在有点搞不清楚的是先提取总RNA,然后买试剂盒的时候买的一步法RT-PCR试剂盒,我看它的说明书是先进行CDNA合成,然后进行pcr扩增。这样做的话产物是什么呢?反应中要我加的引物是我针对该基因序列设计出来的引物吗?那后续做荧光定量pcr时所加的模板就是前面做出来的pcr产物吗?引物还是加这个基因的特异性引物?
     才接触这块,请多多指教,谢谢
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wangranjun

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广庭之惘然

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【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
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G号糖: 金币+2, 有帮助 2016-05-12 16:03:04
G号糖: 金币+5, ★★★很有帮助 2016-05-12 17:12:13
RT-PCR和RT-qPCR是有区别的。想做荧光定量PCR需要加入类似sybr green的染料。看楼主的描述似乎不是荧光定量。cDNA加入引物扩增出来是目的片段,若是做荧光定量的时候,加入的模板也是cDNA。
他日扬翼九万里,历大千世界,定我红尘心!
2楼2016-05-12 15:05:25
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wangranjun

荣誉版主 (知名作家)

广庭之惘然

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引用回帖:
5楼: Originally posted by G号糖 at 2016-05-12 17:07:15
那就是买的这个试剂盒并不适合,得买RNA转录的试剂盒?...

我们做荧光定量的时候会用专门的逆转录试剂盒,很少会用这种一步法
他日扬翼九万里,历大千世界,定我红尘心!
6楼2016-05-12 18:02:31
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chaperonesy

新虫 (小有名气)

我们一般也都是先提取总RNA,然后反转,以cDNA为模板做q-PCR

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9楼2016-05-13 13:52:23
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wx3280065

银虫 (小有名气)

cDNA合成就是反转录的过程,你会发现试剂盒中会给你提供oligo dt和随机六聚体引物,oligo dt为一段特殊的多聚t引物,可以特异的结合到mRNA的poly a上,所以用oligo dt反转录出来的产物为mRNA对应的cDNA,随机引物则会将总RNA反转录出来。推荐你多看看分子克隆这本书。此外RT-PCR为反转录PCR而荧光定量PCR为RT-qPCR,rt-qpcr和反转录的过程是独立的两个实验,首先将RNA反转录为cDNA然后在以合成的cDNA为模版做qPCR

发自小木虫Android客户端
14楼2016-05-14 20:10:10
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G号糖

木虫 (正式写手)

引用回帖:
10楼: Originally posted by xuewenfeng at 2016-05-13 16:59:22
我也做这个,但是反转录之后,做DNA验证的时候,做不出来,或者只有几个出来,怎么办?...

你是怎么做DNA验证呢?
18楼2016-05-15 19:36:29
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普通回帖

G号糖

木虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by wangranjun at 2016-05-12 15:05:25
RT-PCR和RT-qPCR是有区别的。想做荧光定量PCR需要加入类似sybr green的染料。看楼主的描述似乎不是荧光定量。cDNA加入引物扩增出来是目的片段,若是做荧光定量的时候,加入的模板也是cDNA。

我是要做荧光定量,在这之前不是要将提出来的RNA反转录吗?以反转录之后的产物cDNA为模板进行qPCR对吧?
现在不明白的是这个一步法RT-PCR试剂盒,现将RNA反转录,再立即进行pcr扩增,这样做出来之后还是我做q-PCR需要的模板了吗?
3楼2016-05-12 15:23:04
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wangranjun

荣誉版主 (知名作家)

广庭之惘然

优秀版主

引用回帖:
3楼: Originally posted by G号糖 at 2016-05-12 15:23:04
我是要做荧光定量,在这之前不是要将提出来的RNA反转录吗?以反转录之后的产物cDNA为模板进行qPCR对吧?
现在不明白的是这个一步法RT-PCR试剂盒,现将RNA反转录,再立即进行pcr扩增,这样做出来之后还是我做q-PCR ...

PCR扩增以后就不能再作为q-PCR的模板了。q-PCR的模板是RNA逆转录后的产物。
他日扬翼九万里,历大千世界,定我红尘心!
4楼2016-05-12 16:55:20
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G号糖

木虫 (正式写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by wangranjun at 2016-05-12 16:55:20
PCR扩增以后就不能再作为q-PCR的模板了。q-PCR的模板是RNA逆转录后的产物。...

那就是买的这个试剂盒并不适合,得买RNA转录的试剂盒?
5楼2016-05-12 17:07:15
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邹忌

铁杆木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
先提取RNA ,再做反转录,利用Cdna做实时定量PCR
不是不能,只是不想
7楼2016-05-12 18:12:56
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star013

新虫 (知名作家)


我们可以提供qpcr和荧光定量服务,价格优惠

发自小木虫Android客户端
8楼2016-05-13 09:47:25
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xuewenfeng

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
8楼: Originally posted by star013 at 2016-05-13 09:47:25
我们可以提供qpcr和荧光定量服务,价格优惠

我也做这个,但是反转录之后,做DNA验证的时候,做不出来,或者只有几个出来,怎么办?
10楼2016-05-13 16:59:22
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