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心中的四月

新虫 (小有名气)

[求助] 急急急,序列比对 已有2人参与

本人菜鸟一个,DNA测序结果出来了,老师让自己比对一下,但是不知道和什么比对,怎么比对,求助大神!急急急

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stone2239

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
可以先在NCBI网站上做blast比对。
6楼2016-05-07 22:40:05
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stone2239

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
7楼: Originally posted by 心中的四月 at 2016-05-08 07:42:08
比对之后出现很多结果,应该怎么看结果?
...

你扩增的是已知序列还是未知序列?你比对的目的是什么呢?如果是看扩增结果正确与否,那就看你的序列是否和数据库中你的目标序列一致。如果是未知序列,根据blast结果可以判断你扩增得到的是什么基因,有什么功能等。
8楼2016-05-08 10:49:28
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stone2239

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
9楼: Originally posted by 心中的四月 at 2016-05-08 10:50:20
我扩增的是未知序列
...

那的确应该先在NCBI网站上做blast比对,你的序列与哪一条最相似,那你的序列功能应该也是一样或类似。

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

11楼2016-05-08 11:06:54
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